choline dehydrogenase

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同義遺伝子名

CHD, CHDH, Choline dehydrogenase, mitochondrial precursor, CDH, choline dehydrogenase

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:13 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:17.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:- 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.31 小脳:- 脳幹:2.42 脳梁:2.57 松果体:0.64 末梢神経:- 脊柱:2.20 網膜:- 目:- 動脈:1.43 静脈:0 リンパ節:1.04 末梢血:- 脾臓:0.32 胸腺:0.23 骨髄:- 脂肪:0.36 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.68 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.88 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.32 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:17.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:25.40     肝臓:10.60        肺:-    膀胱:- 腎臓:467.90 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:35.60 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:1.26 胎盤:0.54 前立腺:1.74 卵巣:1.08 精巣:1.39 心臓:1.25 骨格筋:0.84 食道:0.82 胃:- 腸:1.87 結腸:2.52     肝臓:3.13    肺:1.27 膀胱:0.26 腎臓:3.11 下垂体:2.09 甲状腺:1.96 副腎:- 膵臓:2.94 乳腺:2.27 唾液腺:3.05
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.66 卵巣:1.13 精巣:1.96 心臓:0.93 骨格筋:1.03 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.32     肝臓:3.66        肺:0.85    膀胱:- 腎臓:3.46 下垂体:- 甲状腺:1.58 副腎:1.24 膵臓:- 乳腺:0.68 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018397
Gene ID 55349
Unigene ID Hs.126688
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000016391
GTEx ID ENSG00000016391

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]  NM_001136240, NM_172264, NM_175343
ラット [0]  

染色体

3p21.1  [53,850,387  -  53,880,417]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR012132  Glucose-methanol-choline oxidoreductase

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

12477932
15146197
15489334
16816108
17975144
18230680
19471022
19737740
20031640
20175737
20237496
20662904
20877624
21308979
21900206
22387881
22558321
24144296

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0019285  glycine betaine biosynthetic process from choline

Cellular Component

GO:0005743  mitochondrial inner membrane

Molecular Function

GO:0008812  choline dehydrogenase activity
GO:0050660  FAD binding