chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2

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同義遺伝子名

GALNACT-2, FLJ43310, chondroitin sulfate GalNAcT-2, PRO0082, CSGalNAcT-2, MGC40204, DKFZp686H13226

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:4.29 小脳:4.63 脳幹:4.59 脳梁:5.05 松果体:- 末梢神経:4.99 脊柱:5 網膜:- 目:- 動脈:4.87 静脈:4.76 リンパ節:5.17 末梢血:- 脾臓:5.67 胸腺:6.40 骨髄:7 脂肪:4.75 骨:- 皮膚:5.12
CAGE 大脳:2.91 小脳:- 脳幹:2.96 脳梁:3.37 松果体:2.50 末梢神経:- 脊柱:3.27 網膜:- 目:- 動脈:3.40 静脈:2.90 リンパ節:3.31 末梢血:- 脾臓:3.45 胸腺:3.48 骨髄:- 脂肪:3.41 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.16 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.89 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.81 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:5.62 胎盤:4.79 前立腺:5.13 卵巣:5 精巣:4.19 心臓:4.52 骨格筋:4.59 食道:3.95 胃:4.65 腸:4.73 結腸:3.94 肝臓:3.99 肺:5.57 膀胱:- 腎臓:3.74 下垂体:4.54 甲状腺:4.12 副腎:4.45 膵臓:4.45 乳腺:4.79 唾液腺:3.51
CAGE 子宮:2.97 胎盤:2.78 前立腺:2.85 卵巣:3.06 精巣:2.59 心臓:3.04 骨格筋:2.81 食道:2.83 胃:- 腸:2.40 結腸:2.56     肝臓:2.75    肺:3.69 膀胱:3.31 腎臓:2.59 下垂体:3.26 甲状腺:2.27 副腎:- 膵臓:1.74 乳腺:2.91 唾液腺:2.17
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.60 卵巣:3.71 精巣:3.13 心臓:2.38 骨格筋:2.57 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.25     肝臓:2.62        肺:4.71    膀胱:- 腎臓:3.13 下垂体:- 甲状腺:3.13 副腎:3.36 膵臓:- 乳腺:3.27 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018590
Gene ID 55454
Unigene ID -
Probe set ID 222235_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000169826
GTEx ID ENSG00000169826

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_030165
ラット[1]  NM_001106616

染色体

10q11.21  [43,633,934  -  43,680,756]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

11788602
12433924
12446672
12477932
14702039
15489334
16385451
19196962
19298595
19946888
22590693

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0005975  carbohydrate metabolic process
GO:0030206  chondroitin sulfate biosynthetic process
GO:0030204  chondroitin sulfate metabolic process
GO:0050650  chondroitin sulfate proteoglycan biosynthetic process
GO:0050653  chondroitin sulfate proteoglycan biosynthetic process, polysaccharide chain biosynthetic process
GO:0050651  dermatan sulfate proteoglycan biosynthetic process
GO:0050652  dermatan sulfate proteoglycan biosynthetic process, polysaccharide chain biosynthetic process
GO:0030203  glycosaminoglycan metabolic process
GO:0030166  proteoglycan biosynthetic process

Cellular Component

GO:0032580  Golgi cisterna membrane
GO:0000139  Golgi membrane
GO:0030173  integral to Golgi membrane

Molecular Function

GO:0008376  acetylgalactosaminyltransferase activity
GO:0047237  glucuronylgalactosylproteoglycan 4-beta-N-acetylgalactosaminyltransferase activity
GO:0046872  metal ion binding