SRY (sex determining region Y)-box 6

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同義遺伝子名

Transcription factor SOX-6, HSSOX6, SOX6, SRY (sex determining region Y)-box 6

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:23.70 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:118.60 目:11.80 動脈:- 静脈:66.60 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:25.60 皮膚:14.40
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.52 小脳:- 脳幹:2.13 脳梁:2.70 松果体:2.37 末梢神経:- 脊柱:2.64 網膜:- 目:- 動脈:2.00 静脈:1.53 リンパ節:1.41 末梢血:- 脾臓:1.34 胸腺:1.33 骨髄:- 脂肪:2.10 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:18.20 前立腺:- 卵巣:149.10 精巣:116.80 心臓:12.80 骨格筋:40.20 食道:- 胃:- 腸:64.80 結腸:17     肝臓:31.70        肺:9.80    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:232 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:17.80 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.13 胎盤:2.13 前立腺:1.55 卵巣:1.89 精巣:3.19 心臓:2.70 骨格筋:3.72 食道:2.04 胃:- 腸:4.21 結腸:2.52     肝臓:2.27    肺:1.76 膀胱:1.47 腎臓:3.59 下垂体:3.88 甲状腺:2.14 副腎:- 膵臓:3.02 乳腺:1.92 唾液腺:1.15
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.29 精巣:0.28 心臓:0.47 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.07 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_017508
Gene ID 55553
Unigene ID Hs.368226
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000110693
GTEx ID ENSG00000110693

オーソログ対応遺伝子

マウス[6]  NM_001025559, NM_001025560, NM_011445
ラット[1]  NM_001024751, NM_001025560, NM_011445

染色体

11p15.1  [15,987,995  -  16,761,138]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000910  High mobility group, HMG1/HMG2
IPR009071  High mobility group, superfamily

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1614875
9755172
10760285
10996314
11076863
11230166
11255018
11256614
11504872
12477932
14530442
14691456
14702039
15489336
15696967
15696972
16258006
16344560
16381901
16442531
17412698
17433257
17961134
19240061
19384854
19453261
19709629
19714249
19801982
19913121
20379614
20395365
20548944
20628086
20966410
21084391
21104366
21262861
21263153
21625884
21728837
21988832
22504420
22547066
22864933
23663701
23667531
23731550
23972371
24249740

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0035051  cardiac cell differentiation
GO:0051216  cartilage development
GO:0000902  cell morphogenesis
GO:0048821  erythrocyte development
GO:0016458  gene silencing
GO:0001701  in utero embryonic development
GO:0042692  muscle cell differentiation
GO:0007517  muscle organ development
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0021778  oligodendrocyte cell fate specification
GO:0032332  positive regulation of chondrocyte differentiation
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0009791  post-embryonic development
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0044212  DNA regulatory region binding
GO:0005515  protein binding
GO:0046982  protein heterodimerization activity
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003700  transcription factor activity