lysine (K)-specific demethylase 4D

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同義遺伝子名

FLJ10251, jumonji domain containing 2D, MGC141909, JMJD2D, JHDM3D, Jumonji domain-containing protein 2D

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:4.70 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:3.67 小脳:3.59 脳幹:3.61 脳梁:3.60 松果体:- 末梢神経:3.66 脊柱:3.76 網膜:- 目:- 動脈:3.62 静脈:3.51 リンパ節:3.61 末梢血:- 脾臓:3.57 胸腺:3.53 骨髄:3.73 脂肪:3.71 骨:- 皮膚:3.60
CAGE 大脳:0.88 小脳:- 脳幹:0.66 脳梁:0.91 松果体:1.06 末梢神経:- 脊柱:0.82 網膜:- 目:- 動脈:0.18 静脈:0.59 リンパ節:0.22 末梢血:- 脾臓:0.66 胸腺:0.37 骨髄:- 脂肪:0.26 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.64 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.09 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.34 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:73.50 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.50 胎盤:3.50 前立腺:3.50 卵巣:3.56 精巣:8.06 心臓:3.74 骨格筋:3.66 食道:3.48 胃:3.52 腸:3.53 結腸:3.68 肝臓:3.59 肺:3.46 膀胱:- 腎臓:3.62 下垂体:3.63 甲状腺:3.57 副腎:3.67 膵臓:3.75 乳腺:3.61 唾液腺:3.50
CAGE 子宮:0.38 胎盤:0.16 前立腺:0.33 卵巣:0.92 精巣:3.70 心臓:0.44 骨格筋:0.66 食道:0.33 胃:- 腸:0.53 結腸:0.12     肝臓:0.26    肺:0.22 膀胱:0.18 腎臓:0.54 下垂体:1.11 甲状腺:0.23 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0.55 唾液腺:0.62
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.24 卵巣:0.70 精巣:4.50 心臓:0.34 骨格筋:0.15 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.03     肝臓:0.23        肺:0.06    膀胱:- 腎臓:0.41 下垂体:- 甲状腺:0.57 副腎:0.59 膵臓:- 乳腺:0.43 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018039
Gene ID 55693
Unigene ID Hs.503598
Probe set ID 220278_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000186280
GTEx ID ENSG00000186280

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_173433
ラット[1]  NM_001079712

染色体

11q21  [94,706,845  -  94,732,682]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
12477932
14702039
15138608
15489334
16554811
16603238
17207460
17555712
18187620
18951430
21145461
21382349
22514644
23219879
24163370
24550317

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0033169  histone H3-K9 demethylation
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0046872  metal ion binding
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen