intraflagellar transport 122 homolog (Chlamydomonas)

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同義遺伝子名

WD repeat domain 10, SPG, WDR10, IFT122, WD repeat protein 10, WDR10p, Intraflagellar transport 122 homolog, WDR140

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:6.50 小脳:6.38 脳幹:6.09 脳梁:6.22 松果体:- 末梢神経:6.47 脊柱:6.06 網膜:- 目:- 動脈:6.60 静脈:6.28 リンパ節:6.29 末梢血:- 脾臓:5.95 胸腺:6.24 骨髄:6.45 脂肪:6.55 骨:- 皮膚:6.64
CAGE 大脳:3.46 小脳:- 脳幹:2.88 脳梁:3.32 松果体:3.35 末梢神経:- 脊柱:2.92 網膜:- 目:- 動脈:3.21 静脈:2.85 リンパ節:2.54 末梢血:- 脾臓:2.39 胸腺:3.07 骨髄:- 脂肪:3.20 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.17 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.58 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:6.67 胎盤:5.61 前立腺:6.39 卵巣:7.14 精巣:9.64 心臓:6.12 骨格筋:5.72 食道:6.22 胃:6.07 腸:5.91 結腸:6.24 肝臓:6.02 肺:6.72 膀胱:- 腎臓:6.71 下垂体:7.10 甲状腺:7.12 副腎:6.21 膵臓:6.24 乳腺:6.99 唾液腺:5.78
CAGE 子宮:3.52 胎盤:2.33 前立腺:2.93 卵巣:3.38 精巣:5.34 心臓:3.15 骨格筋:2.48 食道:2.47 胃:- 腸:2.38 結腸:2.78     肝臓:2.55    肺:2.83 膀胱:2.89 腎臓:3.27 下垂体:4.03 甲状腺:3.10 副腎:- 膵臓:2.81 乳腺:2.64 唾液腺:2.95
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.31 精巣:4.84 心臓:0.08 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.17    膀胱:- 腎臓:0.36 下垂体:- 甲状腺:0.07 副腎:0.35 膵臓:- 乳腺:0.42 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_052989
Gene ID 55764
Unigene ID -
Probe set ID 220744_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000163913
GTEx ID ENSG00000163913

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001167763, NM_031177
ラット[2]  NM_001167763, NM_031177

染色体

3q21.3  [129,158,968  -  129,239,198]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001680  WD40 repeat
IPR019782  WD40 repeat 2
IPR019781  WD40 repeat, subgroup
IPR011046  WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986  WD40-repeat-containing domain
IPR015943  WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8125298
11242542
12477932
14702039
16344560
16751776
18029348
19946888
20301743
20493458
21890473
21906983
22190034
22505724
24027799
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0048593  camera-type eye morphogenesis
GO:0060830  ciliary receptor clustering involved in smoothened signaling pathway
GO:0060271  cilium morphogenesis
GO:0010172  embryonic body morphogenesis
GO:0042733  embryonic digit morphogenesis
GO:0035050  embryonic heart tube development
GO:0060173  limb development
GO:0045879  negative regulation of smoothened signaling pathway
GO:0001843  neural tube closure
GO:0060831  smoothened signaling pathway involved in dorsal/ventral neural tube patterning

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0030991  intraflagellar transport particle A
GO:0005932  microtubule basal body
GO:0032391  photoreceptor connecting cilium

Molecular Function

GO:0005515  protein binding