tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1

同義遺伝子名

SCAN1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, Tyr-DNA phosphodiesterase 1, TDP1, MGC104252, FLJ11090

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:27.30

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:29.40

動脈:60

静脈:-

リンパ節:70.80

末梢血:-

脾臓:75.60

胸腺:25.80

骨髄:39.40

脂肪:-

骨:25.60

皮膚:9.60

GeneChip

大脳:5.09

小脳:5.11

脳幹:5.11

脳梁:5.07

松果体:-

末梢神経:4.97

脊柱:5.11

網膜:-

目:-

動脈:5.13

静脈:4.91

リンパ節:5.55

末梢血:-

脾臓:5.46

胸腺:6.57

骨髄:5.99

脂肪:5.47

骨:-

皮膚:5.41

CAGE

大脳:2.18

小脳:-

脳幹:1.90

脳梁:2.06

松果体:2.15

末梢神経:-

脊柱:1.93

網膜:-

目:-

動脈:1.72

静脈:2.11

リンパ節:2.64

末梢血:-

脾臓:2.36

胸腺:3.14

骨髄:-

脂肪:1.84

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.27

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.78

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.30

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:58.30

前立腺:-

卵巣:-

精巣:95.20

心臓:76.60

骨格筋:-

食道:685.60

胃:-

腸:-

結腸:42.40

肝臓:-

肺:29.30

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:163.70

副腎:-

膵臓:35.60

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.28

胎盤:5.34

前立腺:5.27

卵巣:5.30

精巣:7.19

心臓:5.01

骨格筋:5.07

食道:5.48

胃:5.20

腸:5.30

結腸:5.41

肝臓:5.08

肺:5.20

膀胱:-

腎臓:5.09

下垂体:5.33

甲状腺:5.06

副腎:5.04

膵臓:5.25

乳腺:5.21

唾液腺:5.27

CAGE

子宮:2.11

胎盤:1.84

前立腺:1.69

卵巣:1.79

精巣:3.34

心臓:1.20

骨格筋:0.70

食道:2.01

胃:-

腸:1.61

結腸:1.57

肝臓:1.29

肺:1.62

膀胱:1.89

腎臓:1.90

下垂体:2.30

甲状腺:1.28

副腎:-

膵臓:1.87

乳腺:1.16

唾液腺:2.01

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.48

卵巣:1.80

精巣:2.30

心臓:0.35

骨格筋:0.56

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.53

肝臓:0.37

肺:1.20

膀胱:-

腎臓:1.71

下垂体:-

甲状腺:0.99

副腎:1.78

膵臓:-

乳腺:1.48

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001008744
Gene ID	55775
Unigene ID	Hs.209945
Probe set ID	219715_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000042088
GTEx ID	ENSG00000042088

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_028354
ラット [0]

染色体

14q32.11 [90,421,283 - 90,511,106]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008219	cell death
GO:0006281	DNA repair
GO:0006302	double-strand break repair
GO:0000012	single strand break repair

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0017005	3'-tyrosyl-DNA phosphodiesterase activity
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0004527	exonuclease activity
GO:0005515	protein binding
GO:0003697	single-stranded DNA binding

tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function