chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1

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同義遺伝子名

beta4GalNAcT, ChGn, FLJ11264

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:3.50

小脳:-

脳幹:2.74

脳梁:3.22

松果体:1.97

末梢神経:-

脊柱:3.39

網膜:-

目:-

動脈:3.18

静脈:3.10

リンパ節:2.83

末梢血:-

脾臓:2.77

胸腺:2.23

骨髄:-

脂肪:3.21

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.31

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.37

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.54

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:10.90

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:3.02

胎盤:3.63

前立腺:3.12

卵巣:3.47

精巣:1.88

心臓:3.10

骨格筋:1.45

食道:2.62

胃:-

腸:1.84

結腸:2.11

肝臓:0.55

肺:2.70

膀胱:2.99

腎臓:1.86

下垂体:2.55

甲状腺:3.81

副腎:-

膵臓:3.02

乳腺:2.83

唾液腺:1.75

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.31

卵巣:1.17

精巣:0.72

心臓:1.63

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.49

肝臓:0.00

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.91

下垂体:-

甲状腺:2.05

副腎:1.94

膵臓:-

乳腺:0.12

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NR_024040
Gene ID	55790
Unigene ID	Hs.613729
Probe set ID	-
Ensembl ID	-
GTEx ID	-

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]
ラット [0]

染色体

8p21.3 [19,261,672 - 19,615,540]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0009653	anatomical structure morphogenesis
GO:0005975	carbohydrate metabolic process
GO:0051216	cartilage development
GO:0008283	cell proliferation
GO:0008037	cell recognition
GO:0030206	chondroitin sulfate biosynthetic process
GO:0030204	chondroitin sulfate metabolic process
GO:0050650	chondroitin sulfate proteoglycan biosynthetic process
GO:0050653	chondroitin sulfate proteoglycan biosynthetic process, polysaccharide chain biosynthetic process
GO:0050651	dermatan sulfate proteoglycan biosynthetic process
GO:0001958	endochondral ossification
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0030203	glycosaminoglycan metabolic process
GO:0015014	heparan sulfate proteoglycan biosynthetic process, polysaccharide chain biosynthetic process
GO:0030210	heparin biosynthetic process
GO:0007399	nervous system development
GO:0030166	proteoglycan biosynthetic process
GO:0046398	UDP-glucuronate metabolic process
GO:0019276	UDP-N-acetylgalactosamine metabolic process

Cellular Component

GO:0032580	Golgi cisterna membrane
GO:0000139	Golgi membrane
GO:0030173	integral to Golgi membrane
GO:0005622	intracellular

Molecular Function

GO:0008376	acetylgalactosaminyltransferase activity
GO:0047238	glucuronosyl-N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 4-beta-N-acetylgalactosaminyltransferase activity
GO:0015020	glucuronosyltransferase activity
GO:0047237	glucuronylgalactosylproteoglycan 4-beta-N-acetylgalactosaminyltransferase activity
GO:0046872	metal ion binding
GO:0008955	peptidoglycan glycosyltransferase activity

chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function