lysine (K)-specific demethylase 3A

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同義遺伝子名

TSGA, KIAA0742, jumonji domain containing 1A, JHDM2A, JMJD1A, JHMD2A, DKFZp686A24246, DKFZp686P07111, JMJD1, jumonji domain containing 1, Jumonji domain-containing protein 1A

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:56.90 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:355.90 目:111.70 動脈:30 静脈:- リンパ節:70.80 末梢血:18.20 脾臓:18.90 胸腺:90.20 骨髄:59 脂肪:- 骨:25.60 皮膚:57.60
GeneChip 大脳:7.07 小脳:6.61 脳幹:7.13 脳梁:7.52 松果体:- 末梢神経:7.05 脊柱:7.58 網膜:- 目:- 動脈:7.36 静脈:7.49 リンパ節:7.48 末梢血:- 脾臓:7.55 胸腺:7.99 骨髄:7.17 脂肪:7.36 骨:- 皮膚:8.01
CAGE 大脳:3.42 小脳:- 脳幹:3.67 脳梁:3.75 松果体:3.42 末梢神経:- 脊柱:3.64 網膜:- 目:- 動脈:3.67 静脈:3.58 リンパ節:3.43 末梢血:- 脾臓:3.47 胸腺:3.98 骨髄:- 脂肪:3.86 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.03 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.40 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.85 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:82 胎盤:7.30 前立腺:56.30 卵巣:111.80 精巣:242.30 心臓:127.70 骨格筋:40.20 食道:- 胃:85 腸:32.40 結腸:25.40     肝臓:42.20        肺:73.30    膀胱:376.80 腎臓:20.80 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:203.10 膵臓:26.70 乳腺:55.80 唾液腺:-
GeneChip 子宮:7.83 胎盤:7.34 前立腺:7.96 卵巣:7.96 精巣:9.20 心臓:7.40 骨格筋:7.11 食道:7.68 胃:7.08 腸:7.22 結腸:6.28 肝臓:6.65 肺:7.90 膀胱:- 腎臓:6.66 下垂体:7.14 甲状腺:7.64 副腎:7.24 膵臓:6.66 乳腺:7.85 唾液腺:6.69
CAGE 子宮:3.85 胎盤:3.24 前立腺:3.80 卵巣:3.66 精巣:4.03 心臓:3.65 骨格筋:3.70 食道:3.68 胃:- 腸:3.69 結腸:3.51     肝臓:2.72    肺:3.61 膀胱:4.12 腎臓:3.02 下垂体:3.64 甲状腺:3.32 副腎:- 膵臓:3.10 乳腺:3.27 唾液腺:3.38
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.16 卵巣:3.08 精巣:4.71 心臓:3.03 骨格筋:3.21 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:3.13     肝臓:1.77        肺:3.38    膀胱:- 腎臓:2.90 下垂体:- 甲状腺:4.03 副腎:3.16 膵臓:- 乳腺:2.72 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001146688
Gene ID 55818
Unigene ID Hs.557425
Probe set ID 212689_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000115548
GTEx ID ENSG00000115548

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001038695, NM_173001
ラット [0]  

染色体

2p11.2  [86,667,770  -  86,719,839]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347  Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9872452
12477932
14702039
15302935
15489334
15815621
16344560
16603237
16619273
17991879
18538129
18713068
18984585
19471969
19615732
19858293
19946888
20042601
20127736
20378615
20823141
21139048
21275466
21282530
21541331
21607773
21890473
21906983
22020899
22318714
22645302
23455924
23546878
23576503
23583388
23593242
23891737
24214985
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0030521  androgen receptor signaling pathway
GO:0046293  formaldehyde biosynthetic process
GO:0033169  histone H3-K9 demethylation
GO:0009755  hormone-mediated signaling pathway
GO:0051573  negative regulation of histone H3-K9 methylation
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0007290  spermatid nucleus elongation
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0050681  androgen receptor binding
GO:0005506  iron ion binding
GO:0016702  oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0003700  transcription factor activity