histone deacetylase 8

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同義遺伝子名

histone deacetylase 8, Histone deacetylase 8, CDA07, HDACL1, HDAC8, HD8, histone deacetylase-like 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:2.63

小脳:-

脳幹:2.91

脳梁:2.74

松果体:3.29

末梢神経:-

脊柱:2.53

網膜:-

目:-

動脈:2.17

静脈:2.03

リンパ節:2.27

末梢血:-

脾臓:2.35

胸腺:2.12

骨髄:-

脂肪:2.34

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.25

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.91

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:2.65

胎盤:2.22

前立腺:2.27

卵巣:2.36

精巣:1.71

心臓:2.20

骨格筋:2.04

食道:2.27

胃:-

腸:2.23

結腸:2.20

肝臓:2.57

肺:2.45

膀胱:2.23

腎臓:2.68

下垂体:3.11

甲状腺:2.71

副腎:-

膵臓:2.71

乳腺:2.02

唾液腺:2.12

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.27

卵巣:1.12

精巣:1.03

心臓:0.52

骨格筋:0.35

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.31

肝臓:0.18

肺:0.82

膀胱:-

腎臓:0.56

下垂体:-

甲状腺:2.47

副腎:1.98

膵臓:-

乳腺:1.56

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001166419
Gene ID	55869
Unigene ID	-
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000147099
GTEx ID	ENSG00000147099

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_027382
ラット[1]	NM_001126373

染色体

Xq13.1 [71,549,366 - 71,792,953]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003084	Histone deacetylase
IPR000286	Histone deacetylase superfamily

GO:0006333	chromatin assembly or disassembly
GO:0016568	chromatin modification
GO:0000278	mitotic cell cycle
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0007062	sister chromatid cohesion
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0000118	histone deacetylase complex
GO:0000228	nuclear chromosome
GO:0005634	nucleus

GO:0004407	histone deacetylase activity
GO:0046872	metal ion binding
GO:0032041	NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
GO:0046969	NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific)
GO:0046970	NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific)
GO:0008134	transcription factor binding

histone deacetylase 8

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function