protocadherin gamma subfamily B, 1

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同義遺伝子名

PCDH-gamma-B1, PCDH-GAMMA-B1, MGC119467, protocadherin gamma subfamily B, 1, PCDHGB1, MGC119466, MGC119469, Protocadherin gamma B1 precursor

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:4.99 小脳:4.77 脳幹:4.91 脳梁:5.06 松果体:- 末梢神経:4.61 脊柱:5.44 網膜:- 目:- 動脈:4.73 静脈:4.52 リンパ節:4.14 末梢血:- 脾臓:4.03 胸腺:4.04 骨髄:4.25 脂肪:4.81 骨:- 皮膚:4.94
CAGE 大脳:2.43 小脳:- 脳幹:2.29 脳梁:2.90 松果体:2.37 末梢神経:- 脊柱:2.63 網膜:- 目:- 動脈:1.16 静脈:0.47 リンパ節:0.40 末梢血:- 脾臓:0.66 胸腺:0.37 骨髄:- 脂肪:1.47 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.81 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.02 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:4.76 胎盤:4.27 前立腺:4.57 卵巣:4.43 精巣:4.44 心臓:4.47 骨格筋:4.63 食道:4.47 胃:4.25 腸:4.48 結腸:4.57 肝臓:4.04 肺:4.56 膀胱:- 腎臓:4.10 下垂体:4.77 甲状腺:4.16 副腎:3.97 膵臓:4.62 乳腺:4.29 唾液腺:4.33
CAGE 子宮:1.90 胎盤:0.68 前立腺:1.74 卵巣:2.01 精巣:0.45 心臓:0.89 骨格筋:0.40 食道:1.50 胃:- 腸:0.73 結腸:1.09     肝臓:0.84    肺:1.25 膀胱:1.49 腎臓:0.88 下垂体:2.92 甲状腺:1.53 副腎:- 膵臓:1.42 乳腺:0.90 唾液腺:1.15
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.00 卵巣:0.87 精巣:0.51 心臓:0 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.10     肝臓:0.00        肺:0.75    膀胱:- 腎臓:0.00 下垂体:- 甲状腺:0.68 副腎:0.18 膵臓:- 乳腺:0.22 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018922
Gene ID 56104
Unigene ID -
Probe set ID 211876_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000254221
GTEx ID ENSG00000254221

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]  
ラット [0]  

染色体

5q31.3  [140,729,828  -  140,892,546]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126  Cadherin
IPR015919  Cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10380929
10716726
10817752
10835267
11230163
12477932

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007156  homophilic cell adhesion

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding