protocadherin beta 11

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

PCDHB11, MGC138337, Protocadherin beta 11 precursor, PCDH-beta11, PCDH-BETA11, protocadherin beta 11, MGC142171

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:4.70 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:4.88 小脳:5.16 脳幹:4.87 脳梁:4.98 松果体:- 末梢神経:4.83 脊柱:4.77 網膜:- 目:- 動脈:4.86 静脈:5.32 リンパ節:4.68 末梢血:- 脾臓:4.66 胸腺:4.41 骨髄:4.81 脂肪:4.92 骨:- 皮膚:4.78
CAGE 大脳:1.79 小脳:- 脳幹:1.35 脳梁:1.41 松果体:1.90 末梢神経:- 脊柱:1.48 網膜:- 目:- 動脈:2.48 静脈:1.17 リンパ節:0.45 末梢血:- 脾臓:1.24 胸腺:0.12 骨髄:- 脂肪:3.04 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.84 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.64 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.13 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:17.80 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.08 胎盤:4.74 前立腺:4.73 卵巣:4.93 精巣:5.17 心臓:5.12 骨格筋:5.12 食道:4.73 胃:4.77 腸:4.90 結腸:4.86 肝臓:4.85 肺:4.87 膀胱:- 腎臓:4.83 下垂体:4.96 甲状腺:4.69 副腎:4.89 膵臓:4.77 乳腺:4.70 唾液腺:4.85
CAGE 子宮:2.37 胎盤:1.43 前立腺:2.12 卵巣:2.81 精巣:1.61 心臓:0.99 骨格筋:1.14 食道:1.99 胃:- 腸:1.48 結腸:1.17     肝臓:1.01    肺:1.25 膀胱:2.26 腎臓:2.15 下垂体:1.81 甲状腺:1.65 副腎:- 膵臓:2.81 乳腺:1.16 唾液腺:1.39
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.01 卵巣:1.95 精巣:1.20 心臓:0.43 骨格筋:0.29 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.70     肝臓:0.04        肺:1.24    膀胱:- 腎臓:0.71 下垂体:- 甲状腺:0.55 副腎:0.77 膵臓:- 乳腺:1.05 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018931
Gene ID 56125
Unigene ID Hs.283084
Probe set ID 221408_x_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000197479
GTEx ID ENSG00000197479

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_053144
ラット[2]  NM_053144

染色体

5q31.3  [140,579,183  -  140,582,618]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126  Cadherin
IPR015919  Cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9182820
10380929
10716726
10817752
10835267
11230163
11322959
12231349
12477932
15489334
19054571
23000965

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016339  calcium-dependent cell-cell adhesion
GO:0007155  cell adhesion
GO:0007156  homophilic cell adhesion
GO:0007399  nervous system development
GO:0007416  synapse assembly
GO:0007268  synaptic transmission

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0005887  integral to plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding