protocadherin beta 8

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同義遺伝子名

PCDH-beta8, Protocadherin 3I, PCDHB8, Protocadherin beta 8 precursor, protocadherin beta 8, PCDH3I, PCDH-BETA8

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:5.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:-
GeneChip 大脳:2.83 小脳:2.86 脳幹:2.90 脳梁:2.87 松果体:- 末梢神経:2.86 脊柱:2.84 網膜:- 目:- 動脈:2.88 静脈:2.94 リンパ節:2.73 末梢血:- 脾臓:2.74 胸腺:3.13 骨髄:2.93 脂肪:2.81 骨:- 皮膚:2.92
CAGE nodata
RNA-seq 大脳:0.86 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.55 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.49 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:8.70 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:2.82 胎盤:2.64 前立腺:2.77 卵巣:2.78 精巣:3.17 心臓:2.78 骨格筋:2.95 食道:2.76 胃:2.80 腸:2.79 結腸:2.76 肝臓:2.67 肺:2.92 膀胱:- 腎臓:2.78 下垂体:2.91 甲状腺:2.80 副腎:2.74 膵臓:2.91 乳腺:2.86 唾液腺:2.79
CAGE nodata
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.66 卵巣:0.50 精巣:0.66 心臓:0.44 骨格筋:0.14 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.42     肝臓:0.02        肺:0.35    膀胱:- 腎臓:0.21 下垂体:- 甲状腺:0.50 副腎:0.44 膵臓:- 乳腺:0.41 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_019120
Gene ID 56128
Unigene ID Hs.287793
Probe set ID 221319_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000120322
GTEx ID ENSG00000120322

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_053141
ラット[1]  NM_053141

染色体

5q31.3  [140,557,371  -  140,560,081]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126  Cadherin
IPR015919  Cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10380929
10716726
10817752
10835267
11230163
11322959
12477932
16344560
17110338
22082156

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007156  homophilic cell adhesion

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding