protocadherin beta 4

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同義遺伝子名

PCDH-BETA4, PCDH-beta4, protocadherin beta 4, Protocadherin beta 4 precursor, PCDHB4

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:11.90 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:70.50 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.98 小脳:- 脳幹:3.12 脳梁:3.31 松果体:2.22 末梢神経:- 脊柱:3.73 網膜:- 目:- 動脈:2.39 静脈:1.34 リンパ節:0.85 末梢血:- 脾臓:1.15 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:2.37 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.98 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.35 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.88 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:- 前立腺:11.30 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:35.60 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:2.58 胎盤:0.88 前立腺:2.51 卵巣:2.62 精巣:1.54 心臓:1.66 骨格筋:1.53 食道:1.64 胃:- 腸:1.05 結腸:1.20     肝臓:0.55    肺:1.44 膀胱:2.57 腎臓:1.70 下垂体:2.55 甲状腺:1.56 副腎:- 膵臓:2.54 乳腺:1.53 唾液腺:2.01
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.19 卵巣:2.04 精巣:1.54 心臓:0.83 骨格筋:0.21 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.94     肝臓:0.08        肺:1.91    膀胱:- 腎臓:1.35 下垂体:- 甲状腺:1.22 副腎:1.19 膵臓:- 乳腺:1.43 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018938
Gene ID 56131
Unigene ID Hs.591250
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000081818
GTEx ID ENSG00000081818

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_053132, NM_053134
ラット[1]  NM_001109390, NM_053134

染色体

5q31.3  [140,501,581  -  140,505,201]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126  Cadherin
IPR015919  Cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10380929
10716726
10817752
10835267
11230163
11322959
12231349
12477932
15489334
16344560
18029348
21890473

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016339  calcium-dependent cell-cell adhesion
GO:0007155  cell adhesion
GO:0007156  homophilic cell adhesion
GO:0007399  nervous system development
GO:0007416  synapse assembly
GO:0007268  synaptic transmission

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0016021  integral to membrane
GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0045111  intermediate filament cytoskeleton
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding