protocadherin alpha subfamily C, 2

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同義遺伝子名

Protocadherin alpha C2 precursor, PCDHAC2, PCDH-ALPHA-C2, MGC71598, PCDH-alpha-C2, protocadherin alpha subfamily C, 2

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST nodata
GeneChip 大脳:6.42 小脳:6.83 脳幹:6.14 脳梁:5.35 松果体:- 末梢神経:6.79 脊柱:6.14 網膜:- 目:- 動脈:3.92 静脈:3.59 リンパ節:4.23 末梢血:- 脾臓:4.27 胸腺:3.39 骨髄:3.43 脂肪:4.27 骨:- 皮膚:3.79
CAGE 大脳:2.26 小脳:- 脳幹:1.57 脳梁:1.70 松果体:2.73 末梢神経:- 脊柱:1.32 網膜:- 目:- 動脈:0.34 静脈:0.96 リンパ節:0.84 末梢血:- 脾臓:1.12 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:0.55 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:2.17 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.65 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST nodata
GeneChip 子宮:4.62 胎盤:3.62 前立腺:4.20 卵巣:4.32 精巣:4.79 心臓:3.52 骨格筋:3.64 食道:3.57 胃:3.82 腸:3.79 結腸:3.80 肝臓:3.46 肺:4.36 膀胱:- 腎臓:4.21 下垂体:6.27 甲状腺:4.39 副腎:4.01 膵臓:5.04 乳腺:4.22 唾液腺:4
CAGE 子宮:0.40 胎盤:0.59 前立腺:0.66 卵巣:0.26 精巣:1.55 心臓:0.68 骨格筋:0.09 食道:0.97 胃:- 腸:0.27 結腸:0.56     肝臓:0.63    肺:1.02 膀胱:0.33 腎臓:0.62 下垂体:1.87 甲状腺:0.32 副腎:- 膵臓:0.94 乳腺:0 唾液腺:0.83
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.21 卵巣:0.13 精巣:0.45 心臓:0.07 骨格筋:0.01 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.27     肝臓:0.14        肺:0.49    膀胱:- 腎臓:0.34 下垂体:- 甲状腺:0.28 副腎:0.75 膵臓:- 乳腺:0.16 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018899
Gene ID 56134
Unigene ID -
Probe set ID 210674_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000243232
GTEx ID ENSG00000243232

オーソログ対応遺伝子

マウス[21]  NM_001003671, NM_001003672, NM_007766, NM_009960, NM_009961, NM_054072, NM_138661, NM_138663, NM_198117
ラット[1]  NM_053933, NM_053934, NM_053939, NM_053942, NM_199486, NM_199503, NM_199505, NM_199506, NM_199509, NM_201422

染色体

5q31.3  [140,345,820  -  140,391,936]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126  Cadherin
IPR015919  Cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10380929
10662547
10716726
10817752
10835267
11230163
12477932
14702039
21906983
22589738

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007155  cell adhesion
GO:0007156  homophilic cell adhesion
GO:0007399  nervous system development

Cellular Component

GO:0005887  integral to plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding