protocadherin alpha 6

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同義遺伝子名

CRNR2, PCDH-alpha6, PCDH-ALPHA6, Protocadherin alpha 6 precursor, PCDHA6, CNR2, CNRS2, CNRN2, protocadherin alpha 6

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:10.70 小脳:37.80 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:3.25 小脳:3.25 脳幹:3.26 脳梁:3.08 松果体:- 末梢神経:3.10 脊柱:3.12 網膜:- 目:- 動脈:3.33 静脈:3.46 リンパ節:3.06 末梢血:- 脾臓:2.96 胸腺:3.01 骨髄:3.15 脂肪:3.24 骨:- 皮膚:3.25
CAGE 大脳:1.86 小脳:- 脳幹:1.71 脳梁:1.36 松果体:2.20 末梢神経:- 脊柱:1.17 網膜:- 目:- 動脈:0.18 静脈:0.34 リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0.17 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:0.63 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.24 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.03 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:- 前立腺:- 卵巣:- 精巣:17.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.10 胎盤:3.10 前立腺:3.03 卵巣:3.03 精巣:3.03 心臓:3.33 骨格筋:3.18 食道:3.12 胃:3.07 腸:3.24 結腸:3.38 肝臓:3.13 肺:3.08 膀胱:- 腎臓:3.16 下垂体:3.38 甲状腺:2.98 副腎:3.28 膵臓:3.30 乳腺:3.05 唾液腺:3.18
CAGE 子宮:0.49 胎盤:0.08 前立腺:0.74 卵巣:0.20 精巣:0.25 心臓:0.18 骨格筋:0.05 食道:0.09 胃:- 腸:0.07 結腸:0.08     肝臓:0.36    肺:0.05 膀胱:0.18 腎臓:0.67 下垂体:2.64 甲状腺:0.23 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:0.36
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.05 卵巣:0.04 精巣:0.06 心臓:0.00 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.17     肝臓:0        肺:0.00    膀胱:- 腎臓:0.27 下垂体:- 甲状腺:0.06 副腎:0.03 膵臓:- 乳腺:0.00 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_018909
Gene ID 56142
Unigene ID Hs.599714
Probe set ID 211811_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000081842
GTEx ID ENSG00000081842

オーソログ対応遺伝子

マウス [0]  
ラット [0]  

染色体

5q31.3  [140,207,563  -  140,391,929]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126  Cadherin
IPR015919  Cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10380929
10612399
10662547
10716726
10817752
10835267
11230163
12477932
15372022
15489334
16344560
17474147
21139048
21145461
22589738

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0007155  cell adhesion
GO:0007156  homophilic cell adhesion
GO:0007399  nervous system development

Cellular Component

GO:0005576  extracellular region
GO:0005887  integral to plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding