presenilin 2 (Alzheimer disease 4)

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同義遺伝子名

AD5, AD3L, STM2, presenilin 2 (Alzheimer disease 4), STM-2, AD3LP, E5-1, PSEN2, Presenilin-2, PSNL2, PS-2, AD4

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:36.70

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:76.40

動脈:30

静脈:-

リンパ節:30.30

末梢血:72.90

脾臓:170.20

胸腺:12.90

骨髄:-

脂肪:80.70

骨:51.20

皮膚:43.20

GeneChip

大脳:4.23

小脳:4.64

脳幹:4.30

脳梁:4.14

松果体:-

末梢神経:4

脊柱:3.95

網膜:-

目:-

動脈:4

静脈:4.43

リンパ節:4.03

末梢血:-

脾臓:3.94

胸腺:3.91

骨髄:4.27

脂肪:4.12

骨:-

皮膚:4.13

CAGE

大脳:1.47

小脳:-

脳幹:1.42

脳梁:1.25

松果体:1.90

末梢神経:-

脊柱:1.11

網膜:-

目:-

動脈:1.68

静脈:1.44

リンパ節:1.60

末梢血:-

脾臓:1.69

胸腺:0.33

骨髄:-

脂肪:1.33

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.40

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.54

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.58

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:82

胎盤:29.10

前立腺:135.20

卵巣:-

精巣:43.30

心臓:63.90

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:64.80

結腸:25.40

肝臓:-

肺:44

膀胱:-

腎臓:72.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:35.60

乳腺:83.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.19

胎盤:4.38

前立腺:4.07

卵巣:4.25

精巣:3.98

心臓:4.47

骨格筋:4.43

食道:4.12

胃:4.23

腸:4.72

結腸:4.52

肝臓:4.39

肺:4.11

膀胱:-

腎臓:4.28

下垂体:4.03

甲状腺:3.90

副腎:4.33

膵臓:4.74

乳腺:3.86

唾液腺:4.31

CAGE

子宮:1.90

胎盤:1.22

前立腺:1.63

卵巣:1.94

精巣:2.10

心臓:1.35

骨格筋:1.32

食道:1.56

胃:-

腸:1.79

結腸:1.60

肝臓:1.33

肺:1.45

膀胱:1.27

腎臓:1.19

下垂体:2.14

甲状腺:0.76

副腎:-

膵臓:1.42

乳腺:1.53

唾液腺:1.49

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.47

卵巣:1.11

精巣:1.04

心臓:0.00

骨格筋:1.26

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.00

肝臓:0.78

肺:1.54

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:1.27

副腎:1.09

膵臓:-

乳腺:0.60

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_012486
Gene ID	5664
Unigene ID	Hs.25363
Probe set ID	204261_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000143801
GTEx ID	ENSG00000143801

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001128605, NM_011183
ラット [0]

染色体

1q42.13 [227,057,885 - 227,083,806]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR006639	Peptidase A22, presenilin signal peptide
IPR001108	Peptidase A22A, presenilin
IPR001493	Peptidase A22A, presenilin 2

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0042987	amyloid precursor protein catabolic process
GO:0042640	anagen
GO:0050435	beta-amyloid metabolic process
GO:0048854	brain morphogenesis
GO:0006816	calcium ion transport
GO:0060048	cardiac muscle contraction
GO:0001708	cell fate specification
GO:0021904	dorsal/ventral neural tube patterning
GO:0030326	embryonic limb morphogenesis
GO:0032469	endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis
GO:0030900	forebrain development
GO:0002244	hemopoietic progenitor cell differentiation
GO:0040011	locomotion
GO:0048286	lung alveolus development
GO:0006509	membrane protein ectodomain proteolysis
GO:0031293	membrane protein intracellular domain proteolysis
GO:0007613	memory
GO:0002573	myeloid leukocyte differentiation
GO:0043066	negative regulation of apoptosis
GO:0001933	negative regulation of protein amino acid phosphorylation
GO:0048011	nerve growth factor receptor signaling pathway
GO:0007220	Notch receptor processing
GO:0007219	Notch signaling pathway
GO:0043065	positive regulation of apoptosis
GO:0043085	positive regulation of catalytic activity
GO:0050820	positive regulation of coagulation
GO:0016485	protein processing
GO:0015031	protein transport
GO:0007176	regulation of epidermal growth factor receptor activity
GO:0043393	regulation of protein binding
GO:0048167	regulation of synaptic plasticity
GO:0001666	response to hypoxia
GO:0001756	somitogenesis
GO:0002286	T cell activation during immune response
GO:0050852	T cell receptor signaling pathway
GO:0048538	thymus development

Cellular Component

GO:0016324	apical plasma membrane
GO:0030424	axon
GO:0005938	cell cortex
GO:0043025	cell soma
GO:0009986	cell surface
GO:0005813	centrosome
GO:0035253	ciliary rootlet
GO:0005829	cytosol
GO:0043198	dendritic shaft
GO:0005783	endoplasmic reticulum
GO:0005789	endoplasmic reticulum membrane
GO:0005794	Golgi apparatus
GO:0000139	Golgi membrane
GO:0030426	growth cone
GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0000776	kinetochore
GO:0005765	lysosomal membrane
GO:0045121	membrane raft
GO:0005743	mitochondrial inner membrane
GO:0031594	neuromuscular junction
GO:0005637	nuclear inner membrane
GO:0048471	perinuclear region of cytoplasm
GO:0005886	plasma membrane
GO:0043234	protein complex
GO:0030018	Z disc

Molecular Function

GO:0004190	aspartic-type endopeptidase activity
GO:0004175	endopeptidase activity
GO:0005515	protein binding

presenilin 2 (Alzheimer disease 4)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function