SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1

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同義遺伝子名

hHEL1, ATP-dependent helicase 1, SMARCAD1, KIAA1122, ETL1, DKFZP762K2015, DKFZp762K2015

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:53.30 小脳:63 脳幹:- 脳梁:- 松果体:296.70 末梢神経:61.30 脊柱:- 網膜:118.60 目:11.80 動脈:89.90 静脈:133.30 リンパ節:70.80 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:25.80 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:12.80 皮膚:33.60
GeneChip nodata
CAGE 大脳:3.42 小脳:- 脳幹:3.35 脳梁:2.86 松果体:3.57 末梢神経:- 脊柱:3.71 網膜:- 目:- 動脈:2.88 静脈:3.40 リンパ節:3.23 末梢血:- 脾臓:3.36 胸腺:4.05 骨髄:- 脂肪:3.00 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.09 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.00 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.36 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:45.60 胎盤:25.50 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:69.20 心臓:38.30 骨格筋:60.30 食道:- 胃:21.20 腸:32.40 結腸:17     肝臓:-        肺:34.20    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:26.70 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:3.42 胎盤:3.10 前立腺:3.22 卵巣:3.02 精巣:3.40 心臓:3.09 骨格筋:2.65 食道:3.08 胃:- 腸:3.07 結腸:3.16     肝臓:3.09    肺:3.31 膀胱:3.03 腎臓:3.31 下垂体:4.07 甲状腺:3.17 副腎:- 膵臓:2.90 乳腺:3.43 唾液腺:2.35
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.27 卵巣:0.89 精巣:1.79 心臓:0.41 骨格筋:0.10 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.00     肝臓:0.00        肺:0.20    膀胱:- 腎臓:0.55 下垂体:- 甲状腺:1.66 副腎:0.21 膵臓:- 乳腺:0.75 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_020159
Gene ID 56916
Unigene ID Hs.410406
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000163104
GTEx ID ENSG00000163104

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_007958
ラット[1]  NM_001107864

染色体

4q22.3  [95,128,762  -  95,212,443]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001  DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021  Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10574461
11031099
12477932
14702039
15302935
15489334
16344560
17081983
18029348
18675275
19471022
20508149
20889312
21139048
21252943
21549307
21693764
21820097
21890473
21906983
22101266
22505724
22863883
22864933
22960744
23000965
23666239
24816145

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0043044  ATP-dependent chromatin remodeling
GO:0016568  chromatin modification
GO:0006338  chromatin remodeling
GO:0051304  chromosome separation
GO:0000729  DNA double-strand break processing
GO:0070932  histone H3 deacetylation
GO:0070933  histone H4 deacetylation
GO:0009117  nucleotide metabolic process
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0051260  protein homooligomerization
GO:0000018  regulation of DNA recombination

Cellular Component

GO:0000792  heterochromatin
GO:0016363  nuclear matrix
GO:0043596  nuclear replication fork
GO:0005730  nucleolus
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0004386  helicase activity
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0005515  protein binding