PR domain containing 8

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同義遺伝子名

PRDM8, PR domain-containing protein 8, PR domain containing 8, PFM5, PR domain zinc finger protein 8

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:41.50 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:129.30 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:19.70 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:-
GeneChip 大脳:4.93 小脳:5.23 脳幹:5.02 脳梁:4.92 松果体:- 末梢神経:4.56 脊柱:4.58 網膜:- 目:- 動脈:5.07 静脈:5.22 リンパ節:4.85 末梢血:- 脾臓:4.59 胸腺:4.55 骨髄:5.21 脂肪:4.91 骨:- 皮膚:5.17
CAGE 大脳:3.82 小脳:- 脳幹:3.66 脳梁:3.77 松果体:1.72 末梢神経:- 脊柱:4.28 網膜:- 目:- 動脈:1.28 静脈:1.29 リンパ節:1.57 末梢血:- 脾臓:0.84 胸腺:0.68 骨髄:- 脂肪:1.12 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.29 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:1.03 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.82 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:7.30 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:8.70 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:-    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.84 胎盤:4.72 前立腺:4.77 卵巣:4.83 精巣:4.59 心臓:4.98 骨格筋:5.37 食道:4.93 胃:4.68 腸:5 結腸:5.04 肝臓:4.86 肺:4.94 膀胱:- 腎臓:4.76 下垂体:4.71 甲状腺:4.53 副腎:4.80 膵臓:5.31 乳腺:4.64 唾液腺:5.02
CAGE 子宮:3.12 胎盤:2.11 前立腺:3.67 卵巣:1.50 精巣:1.11 心臓:1.50 骨格筋:1.35 食道:1.52 胃:- 腸:1.07 結腸:1.87     肝臓:0.26    肺:1.06 膀胱:3.17 腎臓:0.49 下垂体:3.68 甲状腺:0.53 副腎:- 膵臓:0 乳腺:1.68 唾液腺:0.62
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:3.10 卵巣:0.66 精巣:0.72 心臓:0.36 骨格筋:0.17 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.23     肝臓:0.02        肺:0.18    膀胱:- 腎臓:0.59 下垂体:- 甲状腺:0.04 副腎:1.08 膵臓:- 乳腺:0.43 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001099403
Gene ID 56978
Unigene ID Hs.373642
Probe set ID 219835_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000152784
GTEx ID ENSG00000152784

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_029947
ラット[1]  NM_029947

染色体

4q21.21  [81,105,033  -  81,125,483]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR015880  Zinc finger, C2H2-like
IPR007087  Zinc finger, C2H2-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

10668202
12477932
14675547
15342556
15489334
19430483
22961547

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0021540  corpus callosum morphogenesis
GO:0021957  corticospinal tract morphogenesis
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0003682  chromatin binding
GO:0003677  DNA binding
GO:0046974  histone methyltransferase activity (H3-K9 specific)
GO:0046872  metal ion binding
GO:0003714  transcription corepressor activity