valyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative)

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同義遺伝子名

DKFZP434L1435, valyl-tRNA synthetase like, Em:AB023048.4, valyl-tRNA synthetase 2-like, VARS2L, MGC138259, MGC142165, VARSL, KIAA1885

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:43.90 小脳:113.30 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:23.50 動脈:30 静脈:- リンパ節:20.20 末梢血:- 脾臓:56.70 胸腺:38.70 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:28.80
GeneChip nodata
CAGE 大脳:2.04 小脳:- 脳幹:1.84 脳梁:2.15 松果体:1.80 末梢神経:- 脊柱:1.83 網膜:- 目:- 動脈:1.82 静脈:2.33 リンパ節:2.14 末梢血:- 脾臓:2.05 胸腺:2.36 骨髄:- 脂肪:1.60 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:3.60 前立腺:33.80 卵巣:- 精巣:47.60 心臓:- 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:64.80 結腸:8.50     肝臓:52.80        肺:53.80    膀胱:- 腎臓:31.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip nodata
CAGE 子宮:1.42 胎盤:1.66 前立腺:1.51 卵巣:1.48 精巣:1.49 心臓:1.65 骨格筋:1.99 食道:2.05 胃:- 腸:1.93 結腸:2.16     肝臓:2.27    肺:1.64 膀胱:1.15 腎臓:2.03 下垂体:1.25 甲状腺:2.01 副腎:- 膵臓:2.26 乳腺:1.80 唾液腺:1.58
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0 卵巣:0 精巣:0 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0     肝臓:0        肺:0    膀胱:- 腎臓:0 下垂体:- 甲状腺:0 副腎:0 膵臓:- 乳腺:0 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001167734
Gene ID 57176
Unigene ID Hs.597526
Probe set ID -
Ensembl ID ENSG00000137411
ENSG00000223494
GTEx ID ENSG00000137411
ENSG00000223494

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_175137
ラット[1]  NM_213563

染色体

6p21.33  [30,876,019  -  30,894,236]
HSCHR6_MHC_MANN  [30,920,701  -  30,938,920]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1898367
11572484
12477932
14702039
18400783
18624398
19851445
20041166
20186120
20503108
20848476
20877624
21890473
21906983
23449627
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0010467  gene expression
GO:0006418  tRNA aminoacylation for protein translation
GO:0006438  valyl-tRNA aminoacylation

Cellular Component

GO:0005739  mitochondrion

Molecular Function

GO:0005524  ATP binding
GO:0004832  valine-tRNA ligase activity