polypyrimidine tract binding protein 1

同義遺伝子名

PTBP1, HNRNPI, Polypyrimidine tract-binding protein 1, PTB3, PTB-T, PTB-1, MGC8461, 57 kDa RNA-binding protein PPTB-1, HNRPI, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein I, MGC10830, PTB2, PTB, hnRNP I, polypyrimidine tract binding protein 1, PTB4, pPTB

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:55.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:148.30

末梢神経:92

脊柱:112.30

網膜:237.30

目:199.80

動脈:30

静脈:66.60

リンパ節:727.90

末梢血:382.60

脾臓:56.70

胸腺:38.70

骨髄:137.80

脂肪:-

骨:38.40

皮膚:110.40

GeneChip

大脳:6.72

小脳:7.04

脳幹:6.50

脳梁:7.46

松果体:-

末梢神経:8.01

脊柱:7.49

網膜:-

目:-

動脈:8.71

静脈:8.54

リンパ節:9.22

末梢血:-

脾臓:9.25

胸腺:9.53

骨髄:9.07

脂肪:8.79

骨:-

皮膚:9.09

CAGE

大脳:3.57

小脳:-

脳幹:3.73

脳梁:4.04

松果体:3.43

末梢神経:-

脊柱:3.74

網膜:-

目:-

動脈:4.66

静脈:4.75

リンパ節:5.10

末梢血:-

脾臓:4.92

胸腺:5.42

骨髄:-

脂肪:4.72

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.90

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.61

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.46

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:118.50

胎盤:710.40

前立腺:67.60

卵巣:186.30

精巣:138.40

心臓:293.70

骨格筋:40.20

食道:-

胃:85

腸:32.40

結腸:135.70

肝臓:190

肺:127.10

膀胱:-

腎臓:156

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:400.10

乳腺:269.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.82

胎盤:9.01

前立腺:8.88

卵巣:9.14

精巣:8.34

心臓:7.77

骨格筋:6.68

食道:9.29

胃:8.78

腸:8.61

結腸:9.09

肝臓:8.66

肺:9.21

膀胱:-

腎臓:8.96

下垂体:8.72

甲状腺:9.29

副腎:8.67

膵臓:8.33

乳腺:9.29

唾液腺:8.82

CAGE

子宮:4.79

胎盤:5.13

前立腺:4.66

卵巣:4.90

精巣:4.66

心臓:4.06

骨格筋:3.18

食道:4.76

胃:-

腸:4.73

結腸:4.74

肝臓:5.09

肺:4.57

膀胱:4.49

腎臓:4.81

下垂体:4.56

甲状腺:4.87

副腎:-

膵臓:4.79

乳腺:4.72

唾液腺:5.13

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.54

卵巣:2.88

精巣:1.83

心臓:0.75

骨格筋:0.23

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.34

肝臓:1.62

肺:4.38

膀胱:-

腎臓:2.64

下垂体:-

甲状腺:2.59

副腎:3.30

膵臓:-

乳腺:2.30

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_031991
Gene ID	5725
Unigene ID	Hs.172550
Probe set ID	211270_x_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000011304
GTEx ID	ENSG00000011304

オーソログ対応遺伝子

マウス[8]	NM_001077363, NM_008956
ラット [0]

染色体

19p13.3 [797,392 - 812,327]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

GO:0000380	alternative nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0010467	gene expression
GO:0006397	mRNA processing
GO:0051148	negative regulation of muscle cell differentiation
GO:0048025	negative regulation of nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0033119	negative regulation of RNA splicing
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0000381	regulation of alternative nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing

GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm

GO:0000166	nucleotide binding
GO:0008187	poly-pyrimidine tract binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

polypyrimidine tract binding protein 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function