amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile)

同義遺伝子名

MGC87187, IAHSP, KIAA1563, FLJ31851, amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile), Alsin, ALS2CR6, Amyotrophic lateral sclerosis protein 2, PLSJ, ALS2, ALSJ

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:3.44

小脳:-

脳幹:3.23

脳梁:3.25

松果体:3.16

末梢神経:-

脊柱:2.92

網膜:-

目:-

動脈:2.64

静脈:2.22

リンパ節:2.17

末梢血:-

脾臓:2.14

胸腺:2.16

骨髄:-

脂肪:2.88

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.64

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.23

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.03

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:3.12

胎盤:2.36

前立腺:2.56

卵巣:2.47

精巣:2.54

心臓:2.82

骨格筋:2.72

食道:2.24

胃:-

腸:2.81

結腸:2.34

肝臓:2.75

肺:2.63

膀胱:2.62

腎臓:2.63

下垂体:3.56

甲状腺:2.54

副腎:-

膵臓:2.71

乳腺:2.11

唾液腺:2.39

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.47

卵巣:1.21

精巣:1.10

心臓:1.12

骨格筋:0.33

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.40

肝臓:1.63

肺:1.32

膀胱:-

腎臓:0.90

下垂体:-

甲状腺:1.55

副腎:1.51

膵臓:-

乳腺:1.41

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001135745
Gene ID	57679
Unigene ID	Hs.621812
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000003393
GTEx ID	ENSG00000003393

オーソログ対応遺伝子

マウス[10]	NM_001159948, NM_028717, NM_146109
ラット[1]	NM_001013413, NM_028717, NM_146109

染色体

2q33.1 [202,565,277 - 202,645,912]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003123

Vacuolar sorting protein 9

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007409	axonogenesis
GO:0001662	behavioral fear response
GO:0008219	cell death
GO:0007032	endosome organization
GO:0016197	endosome transport
GO:0001701	in utero embryonic development
GO:0007626	locomotory behavior
GO:0007528	neuromuscular junction development
GO:0048812	neuron projection morphogenesis
GO:0045860	positive regulation of protein kinase activity
GO:0032855	positive regulation of Rac GTPase activity
GO:0035022	positive regulation of Rac protein signal transduction
GO:0008104	protein localization
GO:0016601	Rac protein signal transduction
GO:0001881	receptor recycling
GO:0051036	regulation of endosome size
GO:0032313	regulation of Rab GTPase activity
GO:0006979	response to oxidative stress
GO:0035249	synaptic transmission, glutamatergic
GO:0016050	vesicle organization

Cellular Component

GO:0030424	axon
GO:0043025	cell soma
GO:0005813	centrosome
GO:0005829	cytosol
GO:0030425	dendrite
GO:0043197	dendritic spine
GO:0005769	early endosome
GO:0030426	growth cone
GO:0030027	lamellipodium
GO:0016020	membrane
GO:0014069	postsynaptic density
GO:0043234	protein complex
GO:0001726	ruffle
GO:0031982	vesicle

Molecular Function

GO:0005085	guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0005543	phospholipid binding
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0043539	protein serine/threonine kinase activator activity
GO:0017137	Rab GTPase binding
GO:0017112	Rab guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0030676	Rac guanyl-nucleotide exchange factor activity
GO:0005087	Ran guanyl-nucleotide exchange factor activity

amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function