protocadherin beta 16

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同義遺伝子名

PCDHB16, protocadherin beta 16, PCDH3X, Protocadherin 3X, PCDHB8a, PCDH-BETA16, PCDH-beta16, KIAA1621, Protocadherin beta 16 precursor, PCDHbeta 16, ME1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:15.40 小脳:25.20 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:-
GeneChip 大脳:2.83 小脳:2.86 脳幹:2.90 脳梁:2.87 松果体:- 末梢神経:2.86 脊柱:2.84 網膜:- 目:- 動脈:2.88 静脈:2.94 リンパ節:2.73 末梢血:- 脾臓:2.74 胸腺:3.13 骨髄:2.93 脂肪:2.81 骨:- 皮膚:2.92
CAGE 大脳:1.84 小脳:- 脳幹:1.78 脳梁:2.52 松果体:2.31 末梢神経:- 脊柱:2.13 網膜:- 目:- 動脈:2.91 静脈:0.96 リンパ節:1.14 末梢血:- 脾臓:1.50 胸腺:0.06 骨髄:- 脂肪:1.97 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:1.30 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.95 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.95 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:18.20 胎盤:3.60 前立腺:- 卵巣:- 精巣:13 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:-     肝臓:-        肺:4.90    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:26.70 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:2.82 胎盤:2.64 前立腺:2.77 卵巣:2.78 精巣:3.17 心臓:2.78 骨格筋:2.95 食道:2.76 胃:2.80 腸:2.79 結腸:2.76 肝臓:2.67 肺:2.92 膀胱:- 腎臓:2.78 下垂体:2.91 甲状腺:2.80 副腎:2.74 膵臓:2.91 乳腺:2.86 唾液腺:2.79
CAGE 子宮:2.82 胎盤:1.57 前立腺:2.65 卵巣:3.10 精巣:1.73 心臓:2.36 骨格筋:1.62 食道:2.12 胃:- 腸:1.39 結腸:1.56     肝臓:1.29    肺:1.36 膀胱:2.66 腎臓:1.87 下垂体:3.17 甲状腺:1.97 副腎:- 膵臓:1.59 乳腺:0.90 唾液腺:1.49
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:1.44 卵巣:1.93 精巣:1.35 心臓:1.04 骨格筋:0.84 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.45     肝臓:0.16        肺:1.53    膀胱:- 腎臓:1.23 下垂体:- 甲状腺:1.42 副腎:1.37 膵臓:- 乳腺:1.16 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_020957
Gene ID 57717
Unigene ID Hs.147674
Probe set ID 221319_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000196963
GTEx ID ENSG00000196963

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_053142
ラット[1]  NM_053142

染色体

5q31.3  [140,560,980  -  140,565,793]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002126  Cadherin
IPR015919  Cadherin-like

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

9182820
10380929
10716726
10817752
10835267
10997877
11230163
11322959
12231349
12477932
12665801
14702039
15489334

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0016339  calcium-dependent cell-cell adhesion
GO:0007156  homophilic cell adhesion
GO:0007416  synapse assembly
GO:0007268  synaptic transmission

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0005886  plasma membrane

Molecular Function

GO:0005509  calcium ion binding