protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6

同義遺伝子名

protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6, SH-PTP1, Hematopoietic cell protein-tyrosine phosphatase, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, PTP1C, PTP-1C, HCPH, SHP1, SHP-1, PTPN6, SHP-1L, Protein-tyrosine phosphatase 1C, Protein-tyrosine phosphatase SHP-1, HPTP1C

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:10.70

小脳:-

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:148.30

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:17.60

動脈:-

静脈:-

リンパ節:273

末梢血:291.50

脾臓:1304.50

胸腺:399.40

骨髄:413.30

脂肪:40.30

骨:179.10

皮膚:81.60

GeneChip

大脳:4.99

小脳:4.75

脳幹:5.30

脳梁:5.46

松果体:-

末梢神経:5.26

脊柱:5.48

網膜:-

目:-

動脈:5.61

静脈:5.74

リンパ節:8.48

末梢血:-

脾臓:8.93

胸腺:8.07

骨髄:8.24

脂肪:6.23

骨:-

皮膚:6.30

CAGE

大脳:1.72

小脳:-

脳幹:2.23

脳梁:2.57

松果体:1.52

末梢神経:-

脊柱:2.13

網膜:-

目:-

動脈:2.22

静脈:4.54

リンパ節:4.77

末梢血:-

脾臓:4.58

胸腺:4.08

骨髄:-

脂肪:2.82

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.30

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.81

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.05

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:45.60

胎盤:54.60

前立腺:45.10

卵巣:-

精巣:-

心臓:25.50

骨格筋:-

食道:-

胃:42.50

腸:259.20

結腸:50.90

肝臓:42.20

肺:161.30

膀胱:251.20

腎臓:41.60

下垂体:-

甲状腺:327.50

副腎:50.80

膵臓:35.60

乳腺:83.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.68

胎盤:5.99

前立腺:6

卵巣:5.77

精巣:5.11

心臓:5.31

骨格筋:5.07

食道:6

胃:6.28

腸:6.25

結腸:6.45

肝臓:6.27

肺:7.69

膀胱:-

腎臓:5.87

下垂体:5.72

甲状腺:6.18

副腎:5.87

膵臓:6

乳腺:6.32

唾液腺:5.84

CAGE

子宮:2.15

胎盤:2.80

前立腺:2.51

卵巣:1.89

精巣:1.38

心臓:1.77

骨格筋:0.98

食道:2.85

胃:-

腸:3.01

結腸:3.07

肝臓:2.52

肺:3.87

膀胱:1.81

腎臓:2.60

下垂体:1.95

甲状腺:2.13

副腎:-

膵臓:2.76

乳腺:1.68

唾液腺:2.72

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.92

卵巣:0.91

精巣:0.89

心臓:0.68

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.00

肝臓:0.57

肺:2.24

膀胱:-

腎臓:1.04

下垂体:-

甲状腺:0.76

副腎:5.03

膵臓:-

乳腺:1.98

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002831
Gene ID	5777
Unigene ID	Hs.63489
Probe set ID	206687_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000111679
GTEx ID	ENSG00000111679

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_001077705, NM_013545
ラット [0]

染色体

12p13.31 [7,055,631 - 7,070,479]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000242

Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006915	apoptosis
GO:0050853	B cell receptor signaling pathway
GO:0007596	blood coagulation
GO:0030154	cell differentiation
GO:0008283	cell proliferation
GO:0019221	cytokine-mediated signaling pathway
GO:0007186	G-protein coupled receptor protein signaling pathway
GO:0060333	interferon-gamma-mediated signaling pathway
GO:0060397	JAK-STAT cascade involved in growth hormone signaling pathway
GO:0050900	leukocyte migration
GO:0042267	natural killer cell mediated cytotoxicity
GO:0008285	negative regulation of cell proliferation
GO:0002924	negative regulation of humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin
GO:0043407	negative regulation of MAP kinase activity
GO:0050732	negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
GO:0042130	negative regulation of T cell proliferation
GO:0050860	negative regulation of T cell receptor signaling pathway
GO:0018108	peptidyl-tyrosine phosphorylation
GO:0008284	positive regulation of cell proliferation
GO:0014068	positive regulation of phosphoinositide 3-kinase cascade
GO:0006470	protein amino acid dephosphorylation
GO:0045577	regulation of B cell differentiation
GO:0070372	regulation of ERK1 and ERK2 cascade
GO:0060334	regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway
GO:0060338	regulation of type I interferon-mediated signaling pathway
GO:0031295	T cell costimulation
GO:0060337	type I interferon-mediated signaling pathway

Cellular Component

GO:0042105	alpha-beta T cell receptor complex
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0016020	membrane
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0001784	phosphotyrosine binding
GO:0005515	protein binding
GO:0019901	protein kinase binding
GO:0004725	protein tyrosine phosphatase activity
GO:0042169	SH2 domain binding
GO:0017124	SH3 domain binding
GO:0005001	transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity

protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function