protein tyrosine phosphatase, receptor type, B

 詳細情報を見る

同義遺伝子名

protein tyrosine phosphatase, receptor type, B, R-PTP-beta, HPTP-BETA, Protein-tyrosine phosphatase beta, PTPB, R-PTP-BETA, MGC59935, DKFZp686E2262, HPTPB, DKFZp686H15164, MGC142023, FLJ44133, PTPRB

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:24.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:- 網膜:- 目:11.80 動脈:30 静脈:199.90 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:75.60 胸腺:38.70 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:12.80 皮膚:9.60
GeneChip 大脳:5.68 小脳:5.24 脳幹:5.76 脳梁:5.44 松果体:- 末梢神経:5.10 脊柱:5.47 網膜:- 目:- 動脈:5.99 静脈:5.92 リンパ節:5.32 末梢血:- 脾臓:6.85 胸腺:4.93 骨髄:4.79 脂肪:6.40 骨:- 皮膚:5.87
CAGE 大脳:2.44 小脳:- 脳幹:2.99 脳梁:2.74 松果体:2.38 末梢神経:- 脊柱:2.50 網膜:- 目:- 動脈:3.47 静脈:3.40 リンパ節:2.35 末梢血:- 脾臓:4.15 胸腺:1.35 骨髄:- 脂肪:4.19 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.43 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.71 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.75 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:36.40 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:13 心臓:63.90 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:25.40     肝臓:21.10        肺:48.90    膀胱:251.20 腎臓:135.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.80 胎盤:6.44 前立腺:5.58 卵巣:5.29 精巣:5.03 心臓:6.76 骨格筋:6.11 食道:5.46 胃:6.03 腸:6.17 結腸:5.91 肝臓:6.13 肺:7.94 膀胱:- 腎臓:6.36 下垂体:5.29 甲状腺:5.78 副腎:6.58 膵臓:5.18 乳腺:5.66 唾液腺:5.30
CAGE 子宮:3.80 胎盤:3.68 前立腺:2.96 卵巣:2.86 精巣:2.38 心臓:4.18 骨格筋:3.32 食道:2.87 胃:- 腸:2.84 結腸:3.25     肝臓:3.24    肺:4.79 膀胱:2.97 腎臓:3.96 下垂体:2.54 甲状腺:3.09 副腎:- 膵臓:1.98 乳腺:4.18 唾液腺:1.58
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.84 卵巣:0.46 精巣:0.65 心臓:1.29 骨格筋:0.08 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.36     肝臓:0.90        肺:1.63    膀胱:- 腎臓:1.12 下垂体:- 甲状腺:1.39 副腎:1.47 膵臓:- 乳腺:0.74 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001109754
Gene ID 5787
Unigene ID Hs.434375
Probe set ID 205846_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000127329
GTEx ID ENSG00000127329

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_029928
ラット[2]  NM_029928

染色体

12q15  [70,910,630  -  71,031,220]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003961  Fibronectin, type III
IPR008957  Fibronectin, type III-like fold
IPR000242  Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1373652
1486802
1645282
2169617
2170109
7575486
7628014
9049255
9118959
9263011
9584610
10557082
10706604
10769382
11313993
12068634
12234928
12477932
12615970
12700241
12840032
12907755
14702039
15144186
15638728
16101282
16344560
17081983
17549794
18361428
19116766
19136612
19167335
19451274
20201926
20301196
20379614
22275360
24451369
24633157

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0001525  angiogenesis
GO:0016311  dephosphorylation
GO:0006796  phosphate metabolic process
GO:0006470  protein amino acid dephosphorylation

Cellular Component

GO:0005887  integral to plasma membrane

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0005001  transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity