protein tyrosine phosphatase, receptor type, B

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同義遺伝子名

protein tyrosine phosphatase, receptor type, B, R-PTP-beta, HPTP-BETA, Protein-tyrosine phosphatase beta, PTPB, R-PTP-BETA, MGC59935, DKFZp686E2262, HPTPB, DKFZp686H15164, MGC142023, FLJ44133, PTPRB

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:24.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:92 脊柱:- 網膜:- 目:11.80 動脈:30 静脈:199.90 リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:75.60 胸腺:38.70 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:12.80 皮膚:9.60
GeneChip 大脳:3.38 小脳:3.45 脳幹:3.45 脳梁:3.23 松果体:- 末梢神経:3.26 脊柱:3.29 網膜:- 目:- 動脈:3.58 静脈:3.31 リンパ節:3.33 末梢血:- 脾臓:4.76 胸腺:3.17 骨髄:3.18 脂肪:3.73 骨:- 皮膚:3.36
CAGE 大脳:2.44 小脳:- 脳幹:2.99 脳梁:2.74 松果体:2.38 末梢神経:- 脊柱:2.50 網膜:- 目:- 動脈:3.47 静脈:3.40 リンパ節:2.35 末梢血:- 脾臓:4.15 胸腺:1.35 骨髄:- 脂肪:4.19 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.43 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.71 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:1.75 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:36.40 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:13 心臓:63.90 骨格筋:20.10 食道:- 胃:- 腸:32.40 結腸:25.40     肝臓:21.10        肺:48.90    膀胱:251.20 腎臓:135.20 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.50 胎盤:3.37 前立腺:3.41 卵巣:3.32 精巣:3.08 心臓:3.80 骨格筋:3.76 食道:3.28 胃:3.46 腸:3.43 結腸:3.44 肝臓:3.63 肺:4.92 膀胱:- 腎臓:3.71 下垂体:3.33 甲状腺:3.49 副腎:3.88 膵臓:3.26 乳腺:3.42 唾液腺:3.24
CAGE 子宮:3.80 胎盤:3.68 前立腺:2.96 卵巣:2.86 精巣:2.38 心臓:4.18 骨格筋:3.32 食道:2.87 胃:- 腸:2.84 結腸:3.25     肝臓:3.24    肺:4.79 膀胱:2.97 腎臓:3.96 下垂体:2.54 甲状腺:3.09 副腎:- 膵臓:1.98 乳腺:4.18 唾液腺:1.58
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.84 卵巣:0.46 精巣:0.65 心臓:1.29 骨格筋:0.08 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:1.36     肝臓:0.90        肺:1.63    膀胱:- 腎臓:1.12 下垂体:- 甲状腺:1.39 副腎:1.47 膵臓:- 乳腺:0.74 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001109754
Gene ID 5787
Unigene ID Hs.434375
Probe set ID 217177_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000127329
GTEx ID ENSG00000127329

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_029928
ラット[2]  NM_029928

染色体

12q15  [70,910,630  -  71,031,220]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003961  Fibronectin, type III
IPR008957  Fibronectin, type III-like fold
IPR000242  Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1373652
1486802
1645282
2169617
2170109
7575486
7628014
9049255
9118959
9263011
9584610
10557082
10706604
10769382
11313993
12068634
12234928
12477932
12615970
12700241
12840032
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14702039
15144186
15638728
16101282
16344560
17081983
17549794
18361428
19116766
19136612
19167335
19451274
20201926
20301196
20379614
22275360
24451369
24633157

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0001525  angiogenesis
GO:0016311  dephosphorylation
GO:0006796  phosphate metabolic process
GO:0006470  protein amino acid dephosphorylation

Cellular Component

GO:0005887  integral to plasma membrane

Molecular Function

GO:0005515  protein binding
GO:0005001  transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity