BRCA1 associated RING domain 1

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同義遺伝子名

BRCA1 associated RING domain 1, BARD1, BARD-1, BRCA1-associated RING domain protein 1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:8.30

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:30.70

脊柱:-

網膜:-

目:5.90

動脈:30

静脈:-

リンパ節:80.90

末梢血:18.20

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:19.70

脂肪:-

骨:-

皮膚:24

GeneChip

大脳:5.22

小脳:4.78

脳幹:5.13

脳梁:5.86

松果体:-

末梢神経:5.40

脊柱:5.66

網膜:-

目:-

動脈:5.91

静脈:6.43

リンパ節:6.44

末梢血:-

脾臓:6

胸腺:7.39

骨髄:6.55

脂肪:5.35

骨:-

皮膚:6.42

CAGE

大脳:1.82

小脳:-

脳幹:2.12

脳梁:2.26

松果体:1.89

末梢神経:-

脊柱:2.40

網膜:-

目:-

動脈:2.53

静脈:2.44

リンパ節:2.38

末梢血:-

脾臓:2.14

胸腺:3.47

骨髄:-

脂肪:2.08

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.16

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.18

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.68

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:14.60

前立腺:11.30

卵巣:37.30

精巣:21.60

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:17

肝臓:10.60

肺:14.70

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:35.60

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.29

胎盤:4.98

前立腺:5.80

卵巣:6.07

精巣:6.91

心臓:5.20

骨格筋:6.06

食道:6.67

胃:5.85

腸:5.67

結腸:5.59

肝臓:4.70

肺:5.89

膀胱:-

腎臓:4.86

下垂体:5.31

甲状腺:5.51

副腎:4.83

膵臓:5.40

乳腺:6.68

唾液腺:5.07

CAGE

子宮:2.59

胎盤:1.86

前立腺:2.38

卵巣:2.29

精巣:2.63

心臓:2.11

骨格筋:2.14

食道:2.67

胃:-

腸:1.93

結腸:2.45

肝臓:0.78

肺:2.39

膀胱:2.60

腎臓:1.11

下垂体:2.30

甲状腺:1.94

副腎:-

膵臓:1.74

乳腺:2.41

唾液腺:1.15

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.11

卵巣:1.45

精巣:2.01

心臓:0.64

骨格筋:1.41

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.67

肝臓:0.29

肺:0.86

膀胱:-

腎臓:0.21

下垂体:-

甲状腺:0.90

副腎:1.20

膵臓:-

乳腺:0.54

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000465
Gene ID	580
Unigene ID	Hs.591642
Probe set ID	205345_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000138376
GTEx ID	ENSG00000138376

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_007525
ラット[1]	NM_022622

染色体

2q35 [215,590,370 - 215,674,428]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007050	cell cycle arrest
GO:0006281	DNA repair
GO:0043066	negative regulation of apoptosis
GO:0031441	negative regulation of mRNA 3'-end processing
GO:0046826	negative regulation of protein export from nucleus
GO:0043065	positive regulation of apoptosis
GO:0045732	positive regulation of protein catabolic process
GO:0016567	protein ubiquitination
GO:0042325	regulation of phosphorylation
GO:0006974	response to DNA damage stimulus
GO:0001894	tissue homeostasis

Cellular Component

GO:0070531	BRCA1-A complex
GO:0031436	BRCA1-BARD1 complex
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0000151	ubiquitin ligase complex

Molecular Function

GO:0019900	kinase binding
GO:0005515	protein binding
GO:0046982	protein heterodimerization activity
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0003723	RNA binding
GO:0004842	ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270	zinc ion binding

BRCA1 associated RING domain 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function