recombination activating gene 1

同義遺伝子名

RNF74, RAG1, recombination activating gene 1, RING finger protein 74, MGC43321, V(D)J recombination-activating protein 1, RAG-1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:3.77

小脳:3.95

脳幹:3.81

脳梁:3.92

松果体:-

末梢神経:3.75

脊柱:3.74

網膜:-

目:-

動脈:3.74

静脈:4.16

リンパ節:3.84

末梢血:-

脾臓:4.01

胸腺:10.74

骨髄:4.37

脂肪:3.72

骨:-

皮膚:3.80

CAGE

大脳:0.26

小脳:-

脳幹:0.67

脳梁:0.52

松果体:1.08

末梢神経:-

脊柱:0.52

網膜:-

目:-

動脈:1.03

静脈:4.97

リンパ節:0.19

末梢血:-

脾臓:1.24

胸腺:7.77

骨髄:-

脂肪:0.46

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.08

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.31

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.19

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:3.81

胎盤:3.84

前立腺:3.67

卵巣:3.94

精巣:3.56

心臓:3.78

骨格筋:3.84

食道:3.85

胃:3.75

腸:3.84

結腸:3.80

肝臓:3.89

肺:3.93

膀胱:-

腎臓:3.84

下垂体:3.62

甲状腺:3.80

副腎:3.78

膵臓:4.10

乳腺:3.82

唾液腺:3.85

CAGE

子宮:0.53

胎盤:0

前立腺:0.58

卵巣:0.20

精巣:0.64

心臓:0.41

骨格筋:0.05

食道:0.33

胃:-

腸:1.05

結腸:0.38

肝臓:0.26

肺:0.54

膀胱:0.18

腎臓:1.17

下垂体:0.34

甲状腺:0.88

副腎:-

膵臓:0.58

乳腺:0

唾液腺:1.00

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.58

卵巣:0.25

精巣:0.40

心臓:0.27

骨格筋:0.07

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.31

肝臓:0.30

肺:0.12

膀胱:-

腎臓:0.88

下垂体:-

甲状腺:0.46

副腎:0.15

膵臓:-

乳腺:0.43

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_000448
Gene ID	5896
Unigene ID	-
Probe set ID	206591_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000166349
GTEx ID	ENSG00000166349

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009019
ラット[1]	NM_053468

染色体

11p12 [36,532,259 - 36,614,706]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

LRG_98 [5,001 - 16,750]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0002250	adaptive immune response
GO:0030183	B cell differentiation
GO:0006310	DNA recombination
GO:0010390	histone monoubiquitination
GO:0006955	immune response
GO:0043154	negative regulation of caspase activity
GO:0070244	negative regulation of thymocyte apoptosis
GO:0002331	pre-B cell allelic exclusion
GO:0051865	protein autoubiquitination
GO:0045580	regulation of T cell differentiation
GO:0033077	T cell differentiation in the thymus
GO:0043029	T cell homeostasis
GO:0048538	thymus development
GO:0033151	V(D)J recombination

Cellular Component

GO:0005634

nucleus

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0004519	endonuclease activity
GO:0042393	histone binding
GO:0046872	metal ion binding
GO:0005515	protein binding
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0004842	ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270	zinc ion binding

recombination activating gene 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function