retinoic acid receptor, gamma

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同義遺伝子名

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:2.40

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:5.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:40.30

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:5.38

小脳:5.46

脳幹:5.40

脳梁:5.19

松果体:-

末梢神経:5.36

脊柱:5.30

網膜:-

目:-

動脈:5.43

静脈:5.56

リンパ節:5.37

末梢血:-

脾臓:5.03

胸腺:4.84

骨髄:5.36

脂肪:5.60

骨:-

皮膚:5.62

CAGE

大脳:1.25

小脳:-

脳幹:1.14

脳梁:1.17

松果体:1.27

末梢神経:-

脊柱:0.65

網膜:-

目:-

動脈:3.02

静脈:2.69

リンパ節:2.92

末梢血:-

脾臓:1.93

胸腺:1.24

骨髄:-

脂肪:1.93

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.13

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.68

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.08

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:22.50

卵巣:-

精巣:26

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:10.60

肺:29.30

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.33

胎盤:5.10

前立腺:5.19

卵巣:5.18

精巣:5.06

心臓:5.56

骨格筋:5.82

食道:5.90

胃:5.42

腸:5.56

結腸:5.76

肝臓:5.40

肺:5.29

膀胱:-

腎臓:5.38

下垂体:5.32

甲状腺:4.99

副腎:5.39

膵臓:5.45

乳腺:5.01

唾液腺:5.42

CAGE

子宮:3.39

胎盤:1.92

前立腺:2.82

卵巣:2.82

精巣:1.74

心臓:2.09

骨格筋:0.66

食道:4.23

胃:-

腸:1.17

結腸:2.23

肝臓:1.12

肺:2.38

膀胱:2.72

腎臓:1.67

下垂体:0.87

甲状腺:2.12

副腎:-

膵臓:1.42

乳腺:2.91

唾液腺:2.22

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.28

卵巣:1.97

精巣:0.94

心臓:0.30

骨格筋:0.04

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.22

肝臓:0.09

肺:1.05

膀胱:-

腎臓:0.23

下垂体:-

甲状腺:0.53

副腎:0.42

膵臓:-

乳腺:0.70

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001042728
Gene ID	5916
Unigene ID	Hs.149774
Probe set ID	204188_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000172819
GTEx ID	ENSG00000172819

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_001042727, NM_011244
ラット[2]	NM_001135249, NM_001135250

染色体

12q13.13 [53,604,354 - 53,626,764]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003070	Orphan nuclear receptor
IPR003078	Retinoic acid receptor
IPR000003	Retinoid X receptor
IPR001723	Steroid hormone receptor
IPR001728	Thyroid hormone receptor
IPR013088	Zinc finger, NHR/GATA-type
IPR001628	Zinc finger, nuclear hormone receptor-type

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0009952	anterior/posterior pattern formation
GO:0071300	cellular response to retinoic acid
GO:0048048	embryonic eye morphogenesis
GO:0035116	embryonic hindlimb morphogenesis
GO:0010467	gene expression
GO:0003430	growth plate cartilage chondrocyte growth
GO:0070384	Harderian gland development
GO:0035264	multicellular organism growth
GO:0008285	negative regulation of cell proliferation
GO:0032331	negative regulation of chondrocyte differentiation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0043065	positive regulation of apoptosis
GO:0008284	positive regulation of cell proliferation
GO:0043068	positive regulation of programmed cell death
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0060740	prostate gland epithelium morphogenesis
GO:0008361	regulation of cell size
GO:0031641	regulation of myelination
GO:0032526	response to retinoic acid
GO:0048384	retinoic acid receptor signaling pathway
GO:0060534	trachea cartilage development
GO:0006367	transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0060070	Wnt receptor signaling pathway through beta-catenin

Cellular Component

GO:0016021	integral to membrane
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0005667	transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003677	DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003708	retinoic acid receptor activity
GO:0046965	retinoid X receptor binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003707	steroid hormone receptor activity
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0008270	zinc ion binding

retinoic acid receptor, gamma

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function