lysine (K)-specific demethylase 5A

同義遺伝子名

RBBP-2, Jumonji/ARID domain-containing protein 1A, retinoblastoma-binding protein 2, jumonji, AT rich interactive domain 1A, Retinoblastoma-binding protein 2, JARID1A, RBBP2

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:53.30

小脳:25.20

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:148.30

末梢神経:122.70

脊柱:112.30

網膜:-

目:64.60

動脈:449.60

静脈:-

リンパ節:161.80

末梢血:18.20

脾臓:132.30

胸腺:116

骨髄:59

脂肪:40.30

骨:76.80

皮膚:81.60

GeneChip

大脳:5.17

小脳:5.29

脳幹:5.16

脳梁:5.67

松果体:-

末梢神経:5.40

脊柱:5.58

網膜:-

目:-

動脈:5.24

静脈:5.43

リンパ節:5.80

末梢血:-

脾臓:6.26

胸腺:6.88

骨髄:5.65

脂肪:5.29

骨:-

皮膚:5.11

CAGE

大脳:3.23

小脳:-

脳幹:3.44

脳梁:3.58

松果体:3.48

末梢神経:-

脊柱:3.25

網膜:-

目:-

動脈:3.29

静脈:3.45

リンパ節:3.48

末梢血:-

脾臓:3.48

胸腺:3.99

骨髄:-

脂肪:3.28

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.12

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.87

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.71

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:63.80

胎盤:69.20

前立腺:202.80

卵巣:37.30

精巣:129.80

心臓:140.50

骨格筋:60.30

食道:-

胃:63.70

腸:-

結腸:118.70

肝臓:158.30

肺:107.50

膀胱:-

腎臓:124.80

下垂体:232

甲状腺:-

副腎:50.80

膵臓:115.60

乳腺:111.50

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.55

胎盤:6.22

前立腺:5.64

卵巣:5.73

精巣:5.80

心臓:5.37

骨格筋:5.38

食道:5.35

胃:5.75

腸:5.35

結腸:5.18

肝臓:5.31

肺:5.73

膀胱:-

腎臓:5.39

下垂体:5.12

甲状腺:5.56

副腎:5.86

膵臓:5.21

乳腺:5.70

唾液腺:5.25

CAGE

子宮:3.45

胎盤:3.26

前立腺:3.15

卵巣:3.26

精巣:3.44

心臓:2.91

骨格筋:2.54

食道:3.09

胃:-

腸:3.25

結腸:3.13

肝臓:2.64

肺:3.45

膀胱:3.10

腎臓:2.94

下垂体:3.39

甲状腺:3.00

副腎:-

膵臓:3.06

乳腺:2.91

唾液腺:2.99

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.70

卵巣:2.97

精巣:3.39

心臓:1.77

骨格筋:1.79

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.29

肝臓:1.57

肺:2.33

膀胱:-

腎臓:2.25

下垂体:-

甲状腺:2.88

副腎:2.88

膵臓:-

乳腺:2.50

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001042603
Gene ID	5927
Unigene ID	Hs.76272
Probe set ID	215698_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000073614
GTEx ID	ENSG00000073614

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_145997
ラット[2]	NM_145997

染色体

12p13.33 [389,223 - 498,620]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003347	Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase
IPR019787	Zinc finger, PHD-finger
IPR001965	Zinc finger, PHD-type

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0016568	chromatin modification
GO:0007275	multicellular organismal development
GO:0045893	positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0019907	cyclin-dependent protein kinase activating kinase holoenzyme complex
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0016706	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors
GO:0016702	oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen
GO:0003700	transcription factor activity
GO:0008270	zinc ion binding

lysine (K)-specific demethylase 5A

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function