tripartite motif-containing 27

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同義遺伝子名

Tripartite motif-containing protein 27, RFP, Ret finger protein, RING finger protein 76, RNF76, tripartite motif-containing 27, Zinc finger protein RFP, TRIM27, ret finger protein

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:56.90 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:445 末梢神経:122.70 脊柱:- 網膜:- 目:129.30 動脈:30 静脈:- リンパ節:111.20 末梢血:36.40 脾臓:18.90 胸腺:12.90 骨髄:39.40 脂肪:80.70 骨:12.80 皮膚:14.40
GeneChip 大脳:5.91 小脳:6.08 脳幹:5.88 脳梁:6.20 松果体:- 末梢神経:6.30 脊柱:6.03 網膜:- 目:- 動脈:6.30 静脈:6 リンパ節:6.66 末梢血:- 脾臓:6.87 胸腺:7.02 骨髄:6.80 脂肪:6.23 骨:- 皮膚:6.25
CAGE 大脳:3.37 小脳:- 脳幹:3.57 脳梁:3.47 松果体:3.19 末梢神経:- 脊柱:3.28 網膜:- 目:- 動脈:3.53 静脈:3.82 リンパ節:3.85 末梢血:- 脾臓:3.74 胸腺:3.81 骨髄:- 脂肪:3.27 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.15 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:4.43 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:3.07 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:63.80 胎盤:69.20 前立腺:78.90 卵巣:74.50 精巣:38.90 心臓:76.60 骨格筋:- 食道:- 胃:106.20 腸:- 結腸:50.90     肝臓:31.70        肺:53.80    膀胱:- 腎臓:52 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:35.60 乳腺:74.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:6.75 胎盤:6.40 前立腺:6.80 卵巣:6.76 精巣:6.27 心臓:6 骨格筋:5.74 食道:6.30 胃:6.63 腸:6.44 結腸:6.54 肝臓:6.82 肺:6.52 膀胱:- 腎臓:6.19 下垂体:6.77 甲状腺:6.53 副腎:6.36 膵臓:6.91 乳腺:6.65 唾液腺:6.62
CAGE 子宮:3.68 胎盤:3.40 前立腺:3.52 卵巣:3.60 精巣:3.39 心臓:3.41 骨格筋:2.48 食道:3.08 胃:- 腸:3.21 結腸:3.60     肝臓:4.02    肺:3.56 膀胱:3.16 腎臓:3.31 下垂体:3.89 甲状腺:3.65 副腎:- 膵臓:4.48 乳腺:3.30 唾液腺:3.93
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:4.20 卵巣:4.24 精巣:3.47 心臓:2.43 骨格筋:2.76 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.79     肝臓:3.89        肺:3.80    膀胱:- 腎臓:4.03 下垂体:- 甲状腺:3.73 副腎:3.85 膵臓:- 乳腺:3.29 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006510
Gene ID 5987
Unigene ID Hs.440382
Probe set ID 212116_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000204713
ENSG00000215641
ENSG00000234495
GTEx ID ENSG00000204713
ENSG00000215641
ENSG00000234495

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_009054
ラット[2]  NM_001106115, NM_001134974

染色体

HSCHR6_MHC_APD  [28,870,783  -  28,891,771]
HSCHR6_MHC_MANN  [28,882,558  -  28,891,771]
HSCHR6_MHC_SSTO  [28,870,844  -  28,891,821]
HSCHR6_MHC_MCF  [28,870,945  -  28,891,932]
HSCHR6_MHC_COX  [28,871,599  -  28,892,590]
6p22.1  [28,870,779  -  28,891,766]
HSCHR6_MHC_QBL  [28,870,783  -  28,891,770]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001870  B302 (SPRY)-like
IPR003879  Butyrophylin-like
IPR003877  SPla/RYanodine receptor SPRY
IPR018355  SPla/RYanodine receptor subgroup
IPR000315  Zinc finger, B-box
IPR020457  Zinc finger, B-box, chordata

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

1437549
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23452853
23752268
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24255178

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0008283  cell proliferation
GO:0002820  negative regulation of adaptive immune response
GO:0045814  negative regulation of gene expression, epigenetic
GO:0006469  negative regulation of protein kinase activity
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0032720  negative regulation of tumor necrosis factor production
GO:0070206  protein trimerization
GO:0016567  protein ubiquitination
GO:0007283  spermatogenesis
GO:0006351  transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005737  cytoplasm
GO:0005887  integral to plasma membrane
GO:0016020  membrane
GO:0031965  nuclear membrane
GO:0005654  nucleoplasm
GO:0005634  nucleus
GO:0016605  PML body

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0046872  metal ion binding
GO:0003676  nucleic acid binding
GO:0005515  protein binding
GO:0004714  transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity
GO:0004842  ubiquitin-protein ligase activity
GO:0008270  zinc ion binding