regulatory factor X, 3 (influences HLA class II expression)

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同義遺伝子名

RFX3, MGC87155, bA32F11.1, Transcription factor RFX3

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:30.80 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:112.30 網膜:- 目:17.60 動脈:- 静脈:- リンパ節:121.30 末梢血:18.20 脾臓:- 胸腺:90.20 骨髄:98.40 脂肪:- 骨:12.80 皮膚:24
GeneChip 大脳:3.72 小脳:3.69 脳幹:3.73 脳梁:3.84 松果体:- 末梢神経:3.77 脊柱:3.77 網膜:- 目:- 動脈:3.81 静脈:3.74 リンパ節:3.74 末梢血:- 脾臓:3.66 胸腺:3.52 骨髄:3.99 脂肪:3.76 骨:- 皮膚:3.67
CAGE 大脳:4.31 小脳:- 脳幹:3.67 脳梁:3.95 松果体:4.61 末梢神経:- 脊柱:4.67 網膜:- 目:- 動脈:3.43 静脈:3.50 リンパ節:3.61 末梢血:- 脾臓:3.63 胸腺:4.24 骨髄:- 脂肪:3.36 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.49 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.32 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.02 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:27.30 胎盤:18.20 前立腺:11.30 卵巣:74.50 精巣:173.10 心臓:25.50 骨格筋:40.20 食道:- 胃:63.70 腸:- 結腸:42.40     肝臓:21.10        肺:48.90    膀胱:- 腎臓:20.80 下垂体:116 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:17.80 乳腺:55.80 唾液腺:-
GeneChip 子宮:3.75 胎盤:3.74 前立腺:3.58 卵巣:3.74 精巣:3.84 心臓:3.78 骨格筋:3.81 食道:3.72 胃:3.76 腸:3.65 結腸:3.82 肝臓:3.68 肺:3.84 膀胱:- 腎臓:3.76 下垂体:3.70 甲状腺:3.61 副腎:3.70 膵臓:3.93 乳腺:3.69 唾液腺:3.68
CAGE 子宮:3.99 胎盤:2.79 前立腺:3.65 卵巣:3.61 精巣:3.85 心臓:3.05 骨格筋:3.18 食道:2.98 胃:- 腸:2.93 結腸:3.32     肝臓:1.95    肺:3.88 膀胱:3.58 腎臓:2.90 下垂体:4.66 甲状腺:3.26 副腎:- 膵臓:2.66 乳腺:3.69 唾液腺:2.43
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.33 卵巣:0.40 精巣:0.66 心臓:0.05 骨格筋:0.00 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.15     肝臓:0.00        肺:0.41    膀胱:- 腎臓:0.14 下垂体:- 甲状腺:0.67 副腎:0.62 膵臓:- 乳腺:0.15 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_002919
Gene ID 5991
Unigene ID Hs.136829
Probe set ID 207234_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000080298
GTEx ID ENSG00000080298

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]  NM_001166414, NM_011265
ラット[1]  NM_001012172, NM_011265

染色体

9p24.2  [3,218,297  -  3,526,004]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

-

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8289803
8600444
8889548
10330134
11682486
12411430
12477932
14702039
15024578
15164053
15489334
16189514
16344560
19671664
20211142
21532573
22415835
23822649
24058526

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0048469  cell maturation
GO:0060285  ciliary cell motility
GO:0042384  cilium assembly
GO:0060287  cilium movement involved in determination of left/right asymmetry
GO:0031018  endocrine pancreas development
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0045944  positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0050796  regulation of insulin secretion
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0000790  nuclear chromatin
GO:0005634  nucleus
GO:0005667  transcription factor complex

Molecular Function

GO:0003677  DNA binding
GO:0044212  DNA regulatory region binding
GO:0005515  protein binding
GO:0003705  RNA polymerase II transcription factor activity, enhancer binding
GO:0003700  transcription factor activity