retinal G protein coupled receptor

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同義遺伝子名

RPE-retinal G protein-coupled receptor, RGR, retinal G protein coupled receptor

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:39.10 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:30.70 脊柱:112.30 網膜:- 目:5.90 動脈:30 静脈:- リンパ節:20.20 末梢血:- 脾臓:18.90 胸腺:25.80 骨髄:19.70 脂肪:40.30 骨:25.60 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:5 小脳:4.87 脳幹:5.11 脳梁:4.75 松果体:- 末梢神経:4.59 脊柱:4.65 網膜:- 目:- 動脈:5 静脈:5.01 リンパ節:4.70 末梢血:- 脾臓:4.56 胸腺:4.39 骨髄:4.95 脂肪:4.93 骨:- 皮膚:4.89
CAGE 大脳:2.23 小脳:- 脳幹:0.37 脳梁:1.73 松果体:1.80 末梢神経:- 脊柱:0.42 網膜:- 目:- 動脈:0 静脈:0 リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:0 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:0 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.45 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.12 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:9.10 胎盤:14.60 前立腺:22.50 卵巣:111.80 精巣:13 心臓:12.80 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:17     肝臓:105.60        肺:19.60    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:50.80 膵臓:35.60 乳腺:9.30 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.63 胎盤:4.65 前立腺:4.49 卵巣:4.63 精巣:4.60 心臓:4.98 骨格筋:5.04 食道:4.75 胃:4.74 腸:4.76 結腸:4.95 肝臓:4.91 肺:4.72 膀胱:- 腎臓:4.87 下垂体:4.91 甲状腺:4.65 副腎:4.82 膵臓:5.07 乳腺:4.53 唾液腺:4.85
CAGE 子宮:0.04 胎盤:0 前立腺:0 卵巣:0.07 精巣:0.04 心臓:0.14 骨格筋:0.05 食道:0 胃:- 腸:0 結腸:0     肝臓:0    肺:0 膀胱:0 腎臓:0 下垂体:0.26 甲状腺:0.17 副腎:- 膵臓:0 乳腺:0 唾液腺:0
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.70 卵巣:0 精巣:0.00 心臓:0 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.07     肝臓:0        肺:0.05    膀胱:- 腎臓:0.02 下垂体:- 甲状腺:0.02 副腎:0 膵臓:- 乳腺:0.01 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_001012722
Gene ID 5995
Unigene ID Hs.154429
Probe set ID 207070_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000148604
GTEx ID ENSG00000148604

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_021340
ラット[1]  NM_001107299

染色体

10q23.1  [86,004,809  -  86,019,716]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000276  7TM GPCR, rhodopsin-like
IPR017452  GPCR, rhodopsin-like superfamily
IPR001793  Retinal pigment epithelium GPCR

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

7789419
7947717
8641686
10581022
11274198
11723126
12477932
12542842
12573668
12843338
15489334
16189514
16385451
16737970
17286855
17679941
18240029
18474598
19450444
20301590
20591486
20801516
21067480
21441953

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006935  chemotaxis
GO:0007186  G-protein coupled receptor protein signaling pathway
GO:0007602  phototransduction
GO:0018298  protein-chromophore linkage
GO:0007601  visual perception

Cellular Component

GO:0005887  integral to plasma membrane

Molecular Function

GO:0004950  chemokine receptor activity
GO:0004930  G-protein coupled receptor activity
GO:0009881  photoreceptor activity
GO:0005515  protein binding