RAR-related orphan receptor B

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同義遺伝子名

ROR-BETA, Nuclear receptor ROR-beta, Nuclear receptor RZR-beta, NR1F2, RZRB, RAR-related orphan receptor B, RORB, bA133M9.1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:66.40 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:355.90 目:229.20 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:12.90 骨髄:- 脂肪:- 骨:- 皮膚:4.80
GeneChip 大脳:4.53 小脳:4.12 脳幹:4.19 脳梁:4.12 松果体:- 末梢神経:4.09 脊柱:4.11 網膜:- 目:- 動脈:4.12 静脈:4.04 リンパ節:4.18 末梢血:- 脾臓:4.05 胸腺:4.01 骨髄:4.16 脂肪:4.08 骨:- 皮膚:4.15
CAGE 大脳:4.05 小脳:- 脳幹:2.53 脳梁:3.11 松果体:5.80 末梢神経:- 脊柱:3.89 網膜:- 目:- 動脈:1.16 静脈:2.42 リンパ節:0.96 末梢血:- 脾臓:0.25 胸腺:2.96 骨髄:- 脂肪:1.76 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.55 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.51 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.69 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:54.70 胎盤:25.50 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:- 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:-     肝臓:10.60        肺:19.60    膀胱:- 腎臓:- 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.43 胎盤:4.23 前立腺:4.25 卵巣:3.97 精巣:4.03 心臓:4.16 骨格筋:4.16 食道:4.06 胃:3.92 腸:4.03 結腸:4 肝臓:4.04 肺:3.98 膀胱:- 腎臓:4.11 下垂体:4.12 甲状腺:4.01 副腎:4.09 膵臓:4.51 乳腺:4.05 唾液腺:4.17
CAGE 子宮:3.45 胎盤:4.34 前立腺:4.02 卵巣:1.69 精巣:1.42 心臓:2.22 骨格筋:0.60 食道:1.86 胃:- 腸:0.66 結腸:1.49     肝臓:0.36    肺:0.55 膀胱:2.38 腎臓:1.86 下垂体:2.78 甲状腺:1.61 副腎:- 膵臓:0 乳腺:1.16 唾液腺:1.28
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.62 卵巣:0.19 精巣:0.59 心臓:0.57 骨格筋:0 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.40     肝臓:0.02        肺:0.52    膀胱:- 腎臓:0.15 下垂体:- 甲状腺:0.37 副腎:0.11 膵臓:- 乳腺:0.08 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_006914
Gene ID 6096
Unigene ID Hs.494178
Probe set ID 206443_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000198963
GTEx ID ENSG00000198963

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]  NM_001043354, NM_146095
ラット[2]  NM_001043354, NM_146095

染色体

9q21.13  [77,112,281  -  77,302,117]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003079  Nuclear receptor ROR
IPR001723  Steroid hormone receptor
IPR001728  Thyroid hormone receptor
IPR013088  Zinc finger, NHR/GATA-type
IPR001628  Zinc finger, nuclear hormone receptor-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

885817
7926749
7935491
8816759
8858107
8889548
8905729
9670004
10860982
11121580
11504880
11689423
11849752
12477932
12958591
15164053
15604093
19839995
19909500
20201926
20379614
22589738
23333304
23396134
24125721

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0042462  eye photoreceptor cell development
GO:0010467  gene expression
GO:0030522  intracellular receptor-mediated signaling pathway
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006355  regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0006367  transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0007601  visual perception

Cellular Component

GO:0005654  nucleoplasm

Molecular Function

GO:0004879  ligand-dependent nuclear receptor activity
GO:0005515  protein binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0003707  steroid hormone receptor activity
GO:0003700  transcription factor activity
GO:0008270  zinc ion binding