S100 calcium binding protein A9

同義遺伝子名

CFAG, S100 calcium binding protein A9 (calgranulin B), S100 calcium-binding protein A9, MAC387, 60B8AG, Calgranulin-B, Calprotectin L1H subunit, S100A9, Leukocyte L1 complex heavy chain, MRP14, CGLB, CAGB, Migration inhibitory factor-related protein 14, S100 calcium binding protein A9, MRP-14, Protein S100-A9, LIAG, NIF, L1AG, S100 calcium-binding protein A9 (calgranulin B)

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:2.40

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:117.50

動脈:89.90

静脈:66.60

リンパ節:40.40

末梢血:164

脾臓:132.30

胸腺:12.90

骨髄:1357.90

脂肪:161.30

骨:25.60

皮膚:345.60

GeneChip

大脳:3.91

小脳:3.66

脳幹:4.12

脳梁:3.64

松果体:-

末梢神経:3.55

脊柱:3.94

網膜:-

目:-

動脈:4.51

静脈:4.53

リンパ節:8.23

末梢血:-

脾臓:7.83

胸腺:6.31

骨髄:12.42

脂肪:5.74

骨:-

皮膚:8.86

CAGE

大脳:2.41

小脳:-

脳幹:2.55

脳梁:1.41

松果体:2.24

末梢神経:-

脊柱:3.15

網膜:-

目:-

動脈:3.79

静脈:3.44

リンパ節:7.42

末梢血:-

脾臓:5.78

胸腺:3.26

骨髄:-

脂肪:3.78

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.51

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:8.43

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:9.09

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:54.70

胎盤:7.30

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:51.10

骨格筋:120.50

食道:-

胃:-

腸:32.40

結腸:17

肝臓:-

肺:92.90

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:8.90

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.37

胎盤:6.74

前立腺:4.37

卵巣:4.16

精巣:3.77

心臓:5.23

骨格筋:3.97

食道:12.30

胃:4.82

腸:4.70

結腸:5.83

肝臓:4.58

肺:7.44

膀胱:-

腎臓:4.09

下垂体:3.84

甲状腺:4.19

副腎:4.10

膵臓:4.40

乳腺:5.37

唾液腺:5.03

CAGE

子宮:5.21

胎盤:4.39

前立腺:2.91

卵巣:3.32

精巣:2.50

心臓:4.13

骨格筋:3.23

食道:8.22

胃:-

腸:2.12

結腸:2.71

肝臓:3.53

肺:5.63

膀胱:3.48

腎臓:2.90

下垂体:2.60

甲状腺:3.96

副腎:-

膵臓:3.61

乳腺:3.47

唾液腺:3.26

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:6.31

卵巣:4.33

精巣:5.95

心臓:5.59

骨格筋:3.70

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:5.11

肝臓:5.94

肺:10.20

膀胱:-

腎臓:5.44

下垂体:-

甲状腺:5.02

副腎:6.90

膵臓:-

乳腺:3.92

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002965
Gene ID	6280
Unigene ID	Hs.112405
Probe set ID	203535_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000163220
GTEx ID	ENSG00000163220

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_009114
ラット [0]

染色体

1q21.3 [153,330,330 - 153,333,503]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR002048	Calcium-binding EF-hand
IPR018249	EF-HAND 2

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006919	activation of caspase activity
GO:0006914	autophagy
GO:0007267	cell-cell signaling
GO:0032602	chemokine production
GO:0002544	chronic inflammatory response
GO:0001816	cytokine production
GO:0042742	defense response to bacterium
GO:0050832	defense response to fungus
GO:0006954	inflammatory response
GO:0045087	innate immune response
GO:0002523	leukocyte migration during inflammatory response
GO:0070488	neutrophil aggregation
GO:0030593	neutrophil chemotaxis
GO:0030307	positive regulation of cell growth
GO:0050729	positive regulation of inflammatory response
GO:0051092	positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
GO:0051493	regulation of cytoskeleton organization
GO:0045471	response to ethanol
GO:0032496	response to lipopolysaccharide
GO:0010043	response to zinc ion
GO:0032119	sequestering of zinc ion
GO:0007165	signal transduction

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005856	cytoskeleton
GO:0005829	cytosol
GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space
GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0016209	antioxidant activity
GO:0050544	arachidonic acid binding
GO:0005509	calcium ion binding
GO:0008017	microtubule binding
GO:0005515	protein binding
GO:0050786	RAGE receptor binding
GO:0004871	signal transducer activity
GO:0008270	zinc ion binding

S100 calcium binding protein A9

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function