scaffold attachment factor B

同義遺伝子名

Scaffold attachment factor B1, scaffold attachment factor B, Scaffold attachment factor B, HET, DKFZp779C1727, SAFB, HSP27 ERE-TATA-binding protein, SAF-B, SAFB1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:193.20

小脳:37.80

脳幹:-

脳梁:87.50

松果体:148.30

末梢神経:-

脊柱:112.30

網膜:-

目:141

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:222.40

末梢血:-

脾臓:75.60

胸腺:167.50

骨髄:1456.30

脂肪:40.30

骨:76.80

皮膚:460.80

GeneChip

大脳:7.50

小脳:8.06

脳幹:7.44

脳梁:7.84

松果体:-

末梢神経:7.20

脊柱:7.26

網膜:-

目:-

動脈:7.44

静脈:7.43

リンパ節:7.92

末梢血:-

脾臓:7.81

胸腺:8.21

骨髄:7.50

脂肪:7.28

骨:-

皮膚:7.39

CAGE

大脳:4.64

小脳:-

脳幹:4.52

脳梁:4.64

松果体:4.89

末梢神経:-

脊柱:4.66

網膜:-

目:-

動脈:4.32

静脈:4.43

リンパ節:4.30

末梢血:-

脾臓:4.56

胸腺:5.01

骨髄:-

脂肪:4.33

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:2.50

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.29

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:3.00

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:63.80

胎盤:375.20

前立腺:642.10

卵巣:74.50

精巣:121.10

心臓:76.60

骨格筋:80.40

食道:-

胃:127.50

腸:32.40

結腸:186.60

肝臓:31.70

肺:92.90

膀胱:-

腎臓:83.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:133.40

乳腺:1226.70

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.51

胎盤:7.56

前立腺:7.22

卵巣:7.68

精巣:7.82

心臓:7.30

骨格筋:7.26

食道:7.41

胃:7.33

腸:7.09

結腸:7.17

肝臓:7.29

肺:7.84

膀胱:-

腎臓:7.24

下垂体:7.42

甲状腺:7.56

副腎:7.49

膵臓:6.67

乳腺:7.57

唾液腺:7.19

CAGE

子宮:4.51

胎盤:4.57

前立腺:4.47

卵巣:4.33

精巣:4.49

心臓:4.31

骨格筋:4.71

食道:4.16

胃:-

腸:4.15

結腸:4.42

肝臓:3.98

肺:4.31

膀胱:4.53

腎臓:4.23

下垂体:4.57

甲状腺:4.18

副腎:-

膵臓:3.93

乳腺:4.29

唾液腺:4.09

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.59

卵巣:2.25

精巣:3.78

心臓:1.23

骨格筋:3.74

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.35

肝臓:0.54

肺:2.37

膀胱:-

腎臓:1.49

下垂体:-

甲状腺:1.67

副腎:2.94

膵臓:-

乳腺:2.38

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002967
Gene ID	6294
Unigene ID	Hs.23978
Probe set ID	201748_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000160633
GTEx ID	ENSG00000160633

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001163300
ラット[2]	NM_001163300

染色体

19p13.3 [5,623,150 - 5,668,488]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006325	chromatin organization
GO:0030520	estrogen receptor signaling pathway
GO:0040007	growth
GO:0042445	hormone metabolic process
GO:0045944	positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0006351	transcription, DNA-dependent

Cellular Component

GO:0005730	nucleolus
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

scaffold attachment factor B

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function