SATB homeobox 1

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同義遺伝子名

Special AT-rich sequence-binding protein 1, DNA-binding protein SATB1, SATB1

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:104.30

小脳:50.40

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:92

脊柱:112.30

網膜:-

目:70.50

動脈:30

静脈:-

リンパ節:151.70

末梢血:91.10

脾臓:56.70

胸腺:1662

骨髄:137.80

脂肪:-

骨:-

皮膚:14.40

GeneChip

大脳:8.61

小脳:8.26

脳幹:8.42

脳梁:8.11

松果体:-

末梢神経:8.22

脊柱:8.46

網膜:-

目:-

動脈:7.87

静脈:7.56

リンパ節:8.83

末梢血:-

脾臓:9.17

胸腺:11.94

骨髄:8.12

脂肪:7.54

骨:-

皮膚:7.41

CAGE

大脳:3.56

小脳:-

脳幹:2.82

脳梁:2.71

松果体:4.20

末梢神経:-

脊柱:3.36

網膜:-

目:-

動脈:3.23

静脈:4.59

リンパ節:3.84

末梢血:-

脾臓:3.34

胸腺:6.36

骨髄:-

脂肪:2.34

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:3.59

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.17

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.59

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:14.60

前立腺:56.30

卵巣:-

精巣:21.60

心臓:63.90

骨格筋:160.70

食道:-

胃:21.20

腸:32.40

結腸:59.40

肝臓:21.10

肺:58.70

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:116

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:44.50

乳腺:55.80

唾液腺:-

GeneChip

子宮:7.78

胎盤:5.33

前立腺:8.69

卵巣:8.32

精巣:6.70

心臓:8.43

骨格筋:9.21

食道:7.60

胃:8.37

腸:8.26

結腸:8.19

肝臓:7.83

肺:8.23

膀胱:-

腎臓:7.68

下垂体:8.56

甲状腺:8.85

副腎:7.68

膵臓:7.81

乳腺:8.05

唾液腺:9.19

CAGE

子宮:2.90

胎盤:0.81

前立腺:3.23

卵巣:2.21

精巣:2.28

心臓:3.42

骨格筋:3.65

食道:2.93

胃:-

腸:2.91

結腸:3.44

肝臓:2.28

肺:3.34

膀胱:3.77

腎臓:2.32

下垂体:3.34

甲状腺:3.22

副腎:-

膵臓:3.52

乳腺:2.59

唾液腺:3.98

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:4.00

卵巣:1.70

精巣:2.55

心臓:2.76

骨格筋:3.49

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:3.54

肝臓:1.66

肺:2.48

膀胱:-

腎臓:2.09

下垂体:-

甲状腺:2.39

副腎:2.49

膵臓:-

乳腺:2.51

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001131010
Gene ID	6304
Unigene ID	Hs.517717
Probe set ID	203408_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000182568
GTEx ID	ENSG00000182568

オーソログ対応遺伝子

マウス[12]	NM_001163630, NM_001163631, NM_001163632, NM_009122
ラット[1]	NM_001012129, NM_001163631, NM_001163632, NM_009122

染色体

3p24.3 [18,386,864 - 18,487,080]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001356	Homeobox
IPR009057	Homeodomain-like
IPR012287	Homeodomain-related

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0050798	activated T cell proliferation
GO:0006915	apoptosis
GO:0043367	CD4-positive, alpha beta T cell differentiation
GO:0043374	CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation
GO:0006921	cell structure disassembly during apoptosis
GO:0006325	chromatin organization
GO:0006338	chromatin remodeling
GO:0008544	epidermis development
GO:0016571	histone methylation
GO:0000122	negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0060004	reflex
GO:0006351	transcription, DNA-dependent
GO:0019048	virus-host interaction

Cellular Component

GO:0005720	nuclear heterochromatin
GO:0016363	nuclear matrix
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus
GO:0016605	PML body

Molecular Function

GO:0003682	chromatin binding
GO:0003690	double-stranded DNA binding
GO:0005515	protein binding
GO:0043565	sequence-specific DNA binding
GO:0003700	transcription factor activity

SATB homeobox 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function