SET binding factor 1

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同義遺伝子名

Myotubularin-related protein 5, DKFZp761D0422, SET binding factor 1, Sbf1, SET-binding factor 1, MTMR5, SBF1, MGC99700

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:61.60 小脳:12.60 脳幹:- 脳梁:29.20 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:224.60 網膜:- 目:23.50 動脈:- 静脈:- リンパ節:222.40 末梢血:72.90 脾臓:- 胸腺:38.70 骨髄:39.40 脂肪:40.30 骨:- 皮膚:43.20
GeneChip 大脳:6.43 小脳:5.87 脳幹:6.36 脳梁:6.46 松果体:- 末梢神経:5.53 脊柱:6.26 網膜:- 目:- 動脈:5.61 静脈:5.39 リンパ節:6.22 末梢血:- 脾臓:5.75 胸腺:6.82 骨髄:5.32 脂肪:5.70 骨:- 皮膚:5.74
CAGE 大脳:3.76 小脳:- 脳幹:3.99 脳梁:4.22 松果体:3.01 末梢神経:- 脊柱:3.57 網膜:- 目:- 動脈:3.06 静脈:3.00 リンパ節:3.02 末梢血:- 脾臓:2.89 胸腺:3.69 骨髄:- 脂肪:2.54 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:3.42 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:3.10 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:2.41 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:65.60 前立腺:33.80 卵巣:37.30 精巣:64.90 心臓:- 骨格筋:40.20 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:84.80     肝臓:-        肺:39.10    膀胱:- 腎臓:41.60 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:168.90 乳腺:37.20 唾液腺:-
GeneChip 子宮:5.39 胎盤:5.24 前立腺:5.38 卵巣:5.31 精巣:8.14 心臓:5.26 骨格筋:5.75 食道:5.92 胃:5.28 腸:5.50 結腸:5.33 肝臓:5.22 肺:5.31 膀胱:- 腎臓:5.43 下垂体:5.42 甲状腺:6.63 副腎:5.63 膵臓:5.04 乳腺:5.51 唾液腺:5.49
CAGE 子宮:2.74 胎盤:2.73 前立腺:2.64 卵巣:2.83 精巣:4.15 心臓:2.57 骨格筋:3.07 食道:3.00 胃:- 腸:2.82 結腸:3.19     肝臓:2.66    肺:2.36 膀胱:2.55 腎臓:2.42 下垂体:2.41 甲状腺:3.20 副腎:- 膵臓:3.13 乳腺:2.83 唾液腺:1.89
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:2.50 卵巣:2.85 精巣:4.11 心臓:2.07 骨格筋:4.06 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:2.25     肝臓:1.79        肺:2.18    膀胱:- 腎臓:2.26 下垂体:- 甲状腺:3.34 副腎:3.23 膵臓:- 乳腺:2.55 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_002972
Gene ID 6305
Unigene ID Hs.589924
Probe set ID 212393_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000100241
GTEx ID ENSG00000100241

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001081030, NM_001170561
ラット[1]  NM_001081030, NM_001170561

染色体

22q13.33  [50,885,184  -  50,913,464]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001849  Pleckstrin homology

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

8889548
9537414
9736772
10591208
10848615
11686296
11994405
12477932
12668758
14702039
15489334
17148452
19343720
19369647
19851296
20198315
20301641
21139048
21900206
22505724
22586326
23382691
23749797
24250222

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0006470  protein amino acid dephosphorylation
GO:0007283  spermatogenesis

Cellular Component

GO:0016021  integral to membrane
GO:0005634  nucleus

Molecular Function

GO:0005543  phospholipid binding
GO:0008138  protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity
GO:0017112  Rab guanyl-nucleotide exchange factor activity