chemokine (C-C motif) ligand 20

同義遺伝子名

SCYA20, CKb4, CCL20, exodus-1, MIP-3a, Beta chemokine exodus-1, chemokine (C-C motif) ligand 20, MIP3A, LARC, Liver and activation-regulated chemokine, Small inducible cytokine A20 precursor, ST38, Macrophage inflammatory protein 3 alpha, CC chemokine LARC, MIP-3-alpha

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:3.60

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:23.50

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:80.90

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:72

GeneChip

大脳:4.02

小脳:4.13

脳幹:3.95

脳梁:4.13

松果体:-

末梢神経:3.97

脊柱:4.22

網膜:-

目:-

動脈:4.10

静脈:4.24

リンパ節:7.31

末梢血:-

脾臓:4.04

胸腺:4.25

骨髄:4.31

脂肪:4.54

骨:-

皮膚:4.38

CAGE

大脳:0.02

小脳:-

脳幹:0.15

脳梁:0

松果体:0.14

末梢神経:-

脊柱:0.36

網膜:-

目:-

動脈:0.59

静脈:1.29

リンパ節:3.45

末梢血:-

脾臓:0.17

胸腺:0.86

骨髄:-

脂肪:0.55

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.10

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.50

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.84

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:106.20

腸:-

結腸:220.50

肝臓:31.70

肺:14.70

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:17.80

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:4.06

胎盤:4.03

前立腺:3.97

卵巣:4.34

精巣:4.32

心臓:4.27

骨格筋:4.08

食道:4.33

胃:6.31

腸:4.71

結腸:5.78

肝臓:4.22

肺:6.40

膀胱:-

腎臓:4.12

下垂体:3.95

甲状腺:3.95

副腎:4.14

膵臓:4.42

乳腺:4.27

唾液腺:4.27

CAGE

子宮:0.92

胎盤:0.48

前立腺:0.62

卵巣:0.82

精巣:0.86

心臓:0.42

骨格筋:0.13

食道:2.61

胃:-

腸:1.95

結腸:1.59

肝臓:1.16

肺:2.92

膀胱:2.95

腎臓:2.07

下垂体:0

甲状腺:0.17

副腎:-

膵臓:0.94

乳腺:0

唾液腺:1.15

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.60

卵巣:0.15

精巣:0.42

心臓:0.04

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.29

肝臓:0.53

肺:5.26

膀胱:-

腎臓:0.00

下垂体:-

甲状腺:0.00

副腎:1.71

膵臓:-

乳腺:0.02

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001130046
Gene ID	6364
Unigene ID	Hs.75498
Probe set ID	205476_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000115009
GTEx ID	ENSG00000115009

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001159738, NM_016960
ラット [0]

染色体

2q36.3 [228,678,558 - 228,682,272]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR001089	Small chemokine, C-X-C
IPR002473	Small chemokine, C-X-C/Interleukin 8
IPR001811	Small chemokine, interleukin-8-like

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007267	cell-cell signaling
GO:0042466	chemokinesis
GO:0006935	chemotaxis
GO:0042742	defense response to bacterium
GO:0006955	immune response
GO:0006954	inflammatory response
GO:0007165	signal transduction

Cellular Component

GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space

Molecular Function

GO:0008009

chemokine activity

chemokine (C-C motif) ligand 20

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function