chemokine (C motif) ligand 1

同義遺伝子名

lymphotactin, Small inducible cytokine C1, SCM-1, Cytokine SCM-1, SCM-1a, chemokine (C motif) ligand 1, XCL1, SCM-1-alpha, LPTN, SCYC1, SCM1, XC chemokine ligand 1, ATAC, LTN, Lymphotactin precursor, Lymphotaxin

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:1.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:18.20

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:4.26

小脳:4.60

脳幹:4.31

脳梁:4.22

松果体:-

末梢神経:4.34

脊柱:4.36

網膜:-

目:-

動脈:4.84

静脈:5.04

リンパ節:5.86

末梢血:-

脾臓:8.07

胸腺:5.70

骨髄:5.63

脂肪:5.05

骨:-

皮膚:5.04

CAGE

大脳:0.04

小脳:-

脳幹:0.23

脳梁:0.13

松果体:0

末梢神経:-

脊柱:0.09

網膜:-

目:-

動脈:1.28

静脈:1.89

リンパ節:1.76

末梢血:-

脾臓:2.01

胸腺:2.82

骨髄:-

脂肪:0.36

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.94

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.05

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:22.50

卵巣:-

精巣:4.30

心臓:12.80

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.13

胎盤:5.41

前立腺:4.35

卵巣:4.99

精巣:4.02

心臓:4.80

骨格筋:4.49

食道:4.57

胃:4.81

腸:4.90

結腸:4.96

肝臓:5.65

肺:5.43

膀胱:-

腎臓:4.38

下垂体:4.20

甲状腺:4.58

副腎:4.31

膵臓:4.57

乳腺:4.73

唾液腺:4.82

CAGE

子宮:1.10

胎盤:1.11

前立腺:0.62

卵巣:0.47

精巣:0.16

心臓:0.38

骨格筋:0.05

食道:0.63

胃:-

腸:0.87

結腸:0.81

肝臓:0.63

肺:1.49

膀胱:1.06

腎臓:0.74

下垂体:0

甲状腺:0.32

副腎:-

膵臓:0.94

乳腺:0

唾液腺:0.83

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.17

卵巣:0.15

精巣:0.20

心臓:0.22

骨格筋:0

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.13

肝臓:0.56

肺:0.96

膀胱:-

腎臓:0.04

下垂体:-

甲状腺:0.32

副腎:1.24

膵臓:-

乳腺:0.08

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002995
Gene ID	6375
Unigene ID	Hs.546295
Probe set ID	214567_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000143184
GTEx ID	ENSG00000143184

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_008510
ラット [0]

染色体

1q24.2 [168,545,711 - 168,551,315]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR008105	Lymphotactin precursor
IPR001811	Small chemokine, interleukin-8-like

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007267	cell-cell signaling
GO:0071353	cellular response to interleukin-4
GO:0006955	immune response
GO:0032689	negative regulation of interferon-gamma production
GO:0032703	negative regulation of interleukin-2 production
GO:0002725	negative regulation of T cell cytokine production
GO:0002826	negative regulation of T-helper 1 type immune response
GO:0043433	negative regulation of transcription factor activity
GO:0045892	negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0030593	neutrophil chemotaxis
GO:0032733	positive regulation of interleukin-10 production
GO:0002690	positive regulation of leukocyte chemotaxis
GO:0090023	positive regulation of neutrophil chemotaxis
GO:0051281	positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol
GO:0010820	positive regulation of T cell chemotaxis
GO:0002726	positive regulation of T cell cytokine production
GO:0001916	positive regulation of T cell mediated cytotoxicity
GO:0050727	regulation of inflammatory response
GO:0051209	release of sequestered calcium ion into cytosol
GO:0009615	response to virus
GO:0007165	signal transduction

Cellular Component

GO:0005576	extracellular region
GO:0005615	extracellular space

Molecular Function

GO:0008009	chemokine activity
GO:0042379	chemokine receptor binding
GO:0042803	protein homodimerization activity

chemokine (C motif) ligand 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function