syndecan 2

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同義遺伝子名

SYND2, Heparan sulfate proteoglycan core protein, Fibroglycan, SDC2, Syndecan-2 precursor, HSPG1, HSPG

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:87.70

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:29.20

松果体:148.30

末梢神経:153.40

脊柱:112.30

網膜:237.30

目:82.30

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:151.70

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:193.30

骨髄:78.70

脂肪:242

骨:38.40

皮膚:192

GeneChip

大脳:6.35

小脳:6.13

脳幹:7.15

脳梁:6.13

松果体:-

末梢神経:7.54

脊柱:7.19

網膜:-

目:-

動脈:8.36

静脈:8.68

リンパ節:5.40

末梢血:-

脾臓:5.80

胸腺:4.78

骨髄:4.45

脂肪:8.30

骨:-

皮膚:7.29

CAGE

大脳:3.63

小脳:-

脳幹:3.33

脳梁:3.41

松果体:3.81

末梢神経:-

脊柱:3.86

網膜:-

目:-

動脈:4.99

静脈:3.91

リンパ節:2.51

末梢血:-

脾臓:3.38

胸腺:1.26

骨髄:-

脂肪:5.15

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.15

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.34

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:5.09

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:136.70

胎盤:112.90

前立腺:56.30

卵巣:149.10

精巣:129.80

心臓:127.70

骨格筋:20.10

食道:-

胃:276.10

腸:97.20

結腸:186.60

肝臓:116.10

肺:97.80

膀胱:125.60

腎臓:41.60

下垂体:347.90

甲状腺:327.50

副腎:152.40

膵臓:168.90

乳腺:297.40

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.51

胎盤:7.33

前立腺:8.13

卵巣:8.14

精巣:6.32

心臓:7.51

骨格筋:6.53

食道:6.26

胃:7.31

腸:7.45

結腸:7.08

肝臓:9.07

肺:6.96

膀胱:-

腎臓:7.76

下垂体:8.72

甲状腺:10.16

副腎:5.85

膵臓:7.41

乳腺:7.49

唾液腺:5.87

CAGE

子宮:4.63

胎盤:4.28

前立腺:4.65

卵巣:4.80

精巣:3.38

心臓:4.10

骨格筋:2.74

食道:3.96

胃:-

腸:3.56

結腸:3.83

肝臓:5.38

肺:3.82

膀胱:4.93

腎臓:4.25

下垂体:4.56

甲状腺:5.97

副腎:-

膵臓:4.06

乳腺:4.16

唾液腺:2.85

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:6.43

卵巣:5.73

精巣:5.16

心臓:3.60

骨格筋:2.68

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:6.15

肝臓:5.77

肺:5.51

膀胱:-

腎臓:4.89

下垂体:-

甲状腺:7.68

副腎:4.13

膵臓:-

乳腺:5.66

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002998
Gene ID	6383
Unigene ID	Hs.150107
Probe set ID	212158_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000169439
GTEx ID	ENSG00000169439

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_008304
ラット [0]

染色体

8q22.1 [97,505,579 - 97,624,000]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008150	biological_process
GO:0005975	carbohydrate metabolic process
GO:0030204	chondroitin sulfate metabolic process
GO:0048813	dendrite morphogenesis
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0006024	glycosaminoglycan biosynthetic process
GO:0006027	glycosaminoglycan catabolic process
GO:0030203	glycosaminoglycan metabolic process
GO:0007603	phototransduction, visible light
GO:0048814	regulation of dendrite morphogenesis
GO:0031000	response to caffeine
GO:0001666	response to hypoxia
GO:0001523	retinoid metabolic process
GO:0042060	wound healing

Cellular Component

GO:0043025	cell soma
GO:0005796	Golgi lumen
GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0043202	lysosomal lumen
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0008092	cytoskeletal protein binding
GO:0030165	PDZ domain binding
GO:0005515	protein binding

syndecan 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function