syndecan 2

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同義遺伝子名

SYND2, Heparan sulfate proteoglycan core protein, Fibroglycan, SDC2, Syndecan-2 precursor, HSPG1, HSPG

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:1.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:5.56

小脳:5.97

脳幹:6.16

脳梁:5.46

松果体:-

末梢神経:6.64

脊柱:6.30

網膜:-

目:-

動脈:7.48

静脈:7.86

リンパ節:5.01

末梢血:-

脾臓:5.50

胸腺:5

骨髄:4.77

脂肪:7.67

骨:-

皮膚:6.83

CAGE

大脳:3.63

小脳:-

脳幹:3.33

脳梁:3.41

松果体:3.81

末梢神経:-

脊柱:3.86

網膜:-

目:-

動脈:4.99

静脈:3.91

リンパ節:2.51

末梢血:-

脾臓:3.38

胸腺:1.26

骨髄:-

脂肪:5.15

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:4.15

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.34

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:5.09

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:10.40

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:8.02

胎盤:7.13

前立腺:7.32

卵巣:7.63

精巣:6.16

心臓:7.14

骨格筋:5.62

食道:6.15

胃:6.75

腸:7.21

結腸:6.60

肝臓:8.25

肺:6.27

膀胱:-

腎臓:6.83

下垂体:7.72

甲状腺:9.07

副腎:5.28

膵臓:7.43

乳腺:6.79

唾液腺:5.44

CAGE

子宮:4.63

胎盤:4.28

前立腺:4.65

卵巣:4.80

精巣:3.38

心臓:4.10

骨格筋:2.74

食道:3.96

胃:-

腸:3.56

結腸:3.83

肝臓:5.38

肺:3.82

膀胱:4.93

腎臓:4.25

下垂体:4.56

甲状腺:5.97

副腎:-

膵臓:4.06

乳腺:4.16

唾液腺:2.85

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:6.43

卵巣:5.73

精巣:5.16

心臓:3.60

骨格筋:2.68

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:6.15

肝臓:5.77

肺:5.51

膀胱:-

腎臓:4.89

下垂体:-

甲状腺:7.68

副腎:4.13

膵臓:-

乳腺:5.66

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_002998
Gene ID	6383
Unigene ID	Hs.598247
Probe set ID	212154_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000169439
GTEx ID	ENSG00000169439

オーソログ対応遺伝子

マウス[3]	NM_008304
ラット [0]

染色体

8q22.1 [97,505,579 - 97,624,000]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0008150	biological_process
GO:0005975	carbohydrate metabolic process
GO:0030204	chondroitin sulfate metabolic process
GO:0048813	dendrite morphogenesis
GO:0030198	extracellular matrix organization
GO:0006024	glycosaminoglycan biosynthetic process
GO:0006027	glycosaminoglycan catabolic process
GO:0030203	glycosaminoglycan metabolic process
GO:0007603	phototransduction, visible light
GO:0048814	regulation of dendrite morphogenesis
GO:0031000	response to caffeine
GO:0001666	response to hypoxia
GO:0001523	retinoid metabolic process
GO:0042060	wound healing

Cellular Component

GO:0043025	cell soma
GO:0005796	Golgi lumen
GO:0005887	integral to plasma membrane
GO:0043202	lysosomal lumen
GO:0005886	plasma membrane

Molecular Function

GO:0008092	cytoskeletal protein binding
GO:0030165	PDZ domain binding
GO:0005515	protein binding

syndecan 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function