PR domain containing 16

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同義遺伝子名

Transcription factor MEL1, KIAA1675, PR domain zinc finger protein 16, PR domain containing 16, PFM13, PR domain-containing protein 16, PRDM16, MEL1

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類 の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳 血 結
EST 大脳:14.20 小脳:- 脳幹:- 脳梁:87.50 松果体:- 末梢神経:122.70 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:- 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:25.80 骨髄:- 脂肪:40.30 骨:- 皮膚:24
GeneChip 大脳:4.20 小脳:4.37 脳幹:4.31 脳梁:4.12 松果体:- 末梢神経:4.29 脊柱:4.13 網膜:- 目:- 動脈:4.64 静脈:4.37 リンパ節:4.27 末梢血:- 脾臓:3.99 胸腺:3.96 骨髄:4.38 脂肪:4.43 骨:- 皮膚:4.58
CAGE 大脳:1.57 小脳:- 脳幹:1.41 脳梁:1.84 松果体:0.56 末梢神経:- 脊柱:1.48 網膜:- 目:- 動脈:3.61 静脈:1.53 リンパ節:0.12 末梢血:- 脾臓:0.45 胸腺:0 骨髄:- 脂肪:0.78 骨:- 皮膚:-
RNA-seq 大脳:0.00 小脳:- 脳幹:- 脳梁:- 松果体:- 末梢神経:- 脊柱:- 網膜:- 目:- 動脈:- 静脈:- リンパ節:0.40 末梢血:- 脾臓:- 胸腺:- 骨髄:- 脂肪:0.00 骨:- 皮膚:-
殖 筋 消 肝 肺 腎 泌
EST 子宮:- 胎盤:3.60 前立腺:22.50 卵巣:- 精巣:4.30 心臓:- 骨格筋:- 食道:- 胃:21.20 腸:- 結腸:25.40     肝臓:10.60        肺:29.30    膀胱:- 腎臓:52 下垂体:- 甲状腺:- 副腎:- 膵臓:- 乳腺:- 唾液腺:-
GeneChip 子宮:4.16 胎盤:4.11 前立腺:3.94 卵巣:4.33 精巣:4.14 心臓:4.28 骨格筋:4.24 食道:4.17 胃:4.35 腸:4.52 結腸:4.36 肝臓:4.04 肺:4.25 膀胱:- 腎臓:4.08 下垂体:4.29 甲状腺:4.19 副腎:4 膵臓:4.93 乳腺:4.04 唾液腺:4.53
CAGE 子宮:1.37 胎盤:0.24 前立腺:0.97 卵巣:1.82 精巣:0.84 心臓:1.52 骨格筋:0.40 食道:0.94 胃:- 腸:2.50 結腸:1.71     肝臓:0.46    肺:1.70 膀胱:0.78 腎臓:2.07 下垂体:0.50 甲状腺:2.58 副腎:- 膵臓:2.86 乳腺:0.90 唾液腺:0.36
RNA-seq 子宮:- 胎盤:- 前立腺:0.70 卵巣:0.24 精巣:0.00 心臓:0.15 骨格筋:0.12 食道:- 胃:- 腸:- 結腸:0.10     肝臓:0.00        肺:0.44    膀胱:- 腎臓:0.56 下垂体:- 甲状腺:0.00 副腎:0.58 膵臓:- 乳腺:0.18 唾液腺:-

詳細情報

IDs

Refseq ID NM_199454
Gene ID 63976
Unigene ID Hs.99500
Probe set ID 220928_s_at  [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID ENSG00000142611
GTEx ID ENSG00000142611

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]  NM_001177995, NM_027504
ラット[1]  NM_001177995, NM_027504

染色体

1p36.32  [2,985,732  -  3,355,185]

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR015880  Zinc finger, C2H2-like
IPR007087  Zinc finger, C2H2-type

Link to Pubmed  (Pubmed ID)

4063527
8547101
11050005
11214970
12168954
12477932
12557231
12816872
14656887
14702039
14712237
16582916
16598304
16637659
18202228
18767145
19049980
19240061
19285866
19505873
19567523
19641492
20101261
20339536
20379614
20634891
21666692
21906983
22039459
22050763
22072275
22383139
22939622
23454374
23524569
23768516
23793025
24021092
24327154
24674449

遺伝子オントロジー  (GO ID)

Biological Process

GO:0050873  brown fat cell differentiation
GO:0030853  negative regulation of granulocyte differentiation
GO:0000122  negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter
GO:0045892  negative regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0030512  negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
GO:0022008  neurogenesis
GO:0060021  palate development
GO:0045893  positive regulation of transcription, DNA-dependent
GO:0043457  regulation of cellular respiration
GO:0035019  somatic stem cell maintenance
GO:0043586  tongue development
GO:0006351  transcription, DNA-dependent
GO:0050872  white fat cell differentiation

Cellular Component

GO:0005634  nucleus
GO:0017053  transcriptional repressor complex

Molecular Function

GO:0046872  metal ion binding
GO:0005515  protein binding
GO:0043565  sequence-specific DNA binding
GO:0046332  SMAD binding
GO:0003713  transcription coactivator activity