sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F

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同義遺伝子名

Sema4, Semaphorin-3F precursor, sema IV, SEMAK, SEMA3F, SEMA-IV, Semaphorin IV, SEMA4, Sema III/F, Sema IV

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:1.20

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:70.50

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:80.70

骨:-

皮膚:67.20

GeneChip

大脳:6.42

小脳:6.74

脳幹:6.42

脳梁:6.44

松果体:-

末梢神経:6.07

脊柱:6.01

網膜:-

目:-

動脈:6.35

静脈:6.77

リンパ節:6.40

末梢血:-

脾臓:6.52

胸腺:5.72

骨髄:6.43

脂肪:6.57

骨:-

皮膚:6.85

CAGE

大脳:2.24

小脳:-

脳幹:2.42

脳梁:2.26

松果体:3.99

末梢神経:-

脊柱:2.20

網膜:-

目:-

動脈:3.72

静脈:3.37

リンパ節:3.53

末梢血:-

脾臓:5.08

胸腺:2.14

骨髄:-

脂肪:3.98

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.97

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.54

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:4.37

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:18.20

胎盤:10.90

前立腺:90.10

卵巣:-

精巣:-

心臓:25.50

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:8.50

肝臓:-

肺:24.40

膀胱:-

腎臓:20.80

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:18.60

唾液腺:-

GeneChip

子宮:6.47

胎盤:6.58

前立腺:6.17

卵巣:6.55

精巣:5.75

心臓:6.92

骨格筋:6.61

食道:7.21

胃:6.66

腸:6.44

結腸:6.68

肝臓:6.55

肺:6.85

膀胱:-

腎臓:6.65

下垂体:6.26

甲状腺:6.26

副腎:6.54

膵臓:6.92

乳腺:6.47

唾液腺:6.76

CAGE

子宮:3.54

胎盤:4.36

前立腺:3.73

卵巣:2.89

精巣:2.27

心臓:3.71

骨格筋:2.88

食道:4.76

胃:-

腸:3.33

結腸:3.15

肝臓:2.60

肺:4.11

膀胱:3.65

腎臓:3.78

下垂体:2.86

甲状腺:3.64

副腎:-

膵臓:2.08

乳腺:4.39

唾液腺:3.65

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:3.15

卵巣:1.71

精巣:1.54

心臓:1.65

骨格筋:1.11

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.89

肝臓:1.06

肺:4.77

膀胱:-

腎臓:3.31

下垂体:-

甲状腺:2.70

副腎:2.82

膵臓:-

乳腺:2.02

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_004186
Gene ID	6405
Unigene ID	Hs.32981
Probe set ID	209730_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000001617
GTEx ID	ENSG00000001617

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_011349
ラット[1]	NM_001108185

染色体

3p21.31 [50,192,478 - 50,226,508]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR003659	Plexin/semaphorin/integrin
IPR001627	Semaphorin/CD100 antigen
IPR015943	WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0048846	axon extension involved in axon guidance
GO:0007411	axon guidance
GO:0048843	negative regulation of axon extension involved in axon guidance
GO:0021675	nerve development
GO:0001755	neural crest cell migration
GO:0048485	sympathetic nervous system development

Cellular Component

GO:0005615	extracellular space
GO:0016020	membrane

Molecular Function

GO:0045499	chemorepellent activity
GO:0004872	receptor activity

sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function