sorting nexin 16

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同義遺伝子名

sorting nexin 16, DKFZp666H147, Sorting nexin-16, SNX16

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:16.60

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:5.90

動脈:-

静脈:-

リンパ節:30.30

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:40.30

骨:-

皮膚:14.40

GeneChip

大脳:3.39

小脳:3.33

脳幹:3.77

脳梁:3.28

松果体:-

末梢神経:4.63

脊柱:3.48

網膜:-

目:-

動脈:3.29

静脈:3.18

リンパ節:3.29

末梢血:-

脾臓:3.87

胸腺:4.07

骨髄:3.21

脂肪:3.53

骨:-

皮膚:3.46

CAGE

大脳:1.97

小脳:-

脳幹:2.25

脳梁:1.38

松果体:1.66

末梢神経:-

脊柱:2.18

網膜:-

目:-

動脈:1.75

静脈:1.61

リンパ節:1.71

末梢血:-

脾臓:2.96

胸腺:2.50

骨髄:-

脂肪:2.33

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.66

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.00

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.35

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:9.10

胎盤:7.30

前立腺:11.30

卵巣:-

精巣:51.90

心臓:-

骨格筋:20.10

食道:342.80

胃:42.50

腸:32.40

結腸:-

肝臓:-

肺:14.70

膀胱:125.60

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:9.30

唾液腺:-

GeneChip

子宮:3.72

胎盤:3.04

前立腺:3.65

卵巣:3.57

精巣:4.48

心臓:3.59

骨格筋:3.30

食道:3.81

胃:3.66

腸:3.30

結腸:3.23

肝臓:3.09

肺:3.12

膀胱:-

腎臓:3.22

下垂体:3.29

甲状腺:3.57

副腎:3.56

膵臓:3.30

乳腺:3.55

唾液腺:3.30

CAGE

子宮:2.44

胎盤:1.83

前立腺:2.66

卵巣:2.36

精巣:2.74

心臓:2.39

骨格筋:2.29

食道:2.93

胃:-

腸:2.60

結腸:2.11

肝臓:2.07

肺:2.27

膀胱:2.34

腎臓:2.74

下垂体:2.35

甲状腺:2.79

副腎:-

膵臓:0.94

乳腺:3.43

唾液腺:1.39

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.00

卵巣:0.31

精巣:0.37

心臓:0.00

骨格筋:0.90

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.44

肝臓:0.00

肺:0.00

膀胱:-

腎臓:0.13

下垂体:-

甲状腺:0.38

副腎:0.10

膵臓:-

乳腺:0.23

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_152837
Gene ID	64089
Unigene ID	Hs.492121
Probe set ID	219793_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000104497
GTEx ID	ENSG00000104497

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_001127191, NM_029068
ラット[1]	NM_022289, NM_029068

染色体

8q21.13 [82,711,816 - 82,755,101]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0007154	cell communication
GO:0045022	early endosome to late endosome transport
GO:0008333	endosome to lysosome transport
GO:0006622	protein targeting to lysosome

Cellular Component

GO:0005769	early endosome
GO:0031901	early endosome membrane
GO:0031313	extrinsic to endosome membrane
GO:0005770	late endosome
GO:0031902	late endosome membrane
GO:0005764	lysosome

Molecular Function

GO:0042802	identical protein binding
GO:0035091	phosphoinositide binding

sorting nexin 16

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function