interferon induced with helicase C domain 1

同義遺伝子名

Melanoma differentiation-associated protein 5, MDA5, interferon induced with helicase C domain 1, Helicase with 2 CARD domains, IFIH1, Helicard, Hlcd, MGC133047, Murabutide-down-regulated protein, MDA-5, RNA helicase-DEAD box protein 116, IDDM19, RH116

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:7.10

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:5.90

動脈:89.90

静脈:-

リンパ節:10.10

末梢血:109.30

脾臓:18.90

胸腺:64.40

骨髄:19.70

脂肪:40.30

骨:51.20

皮膚:24

GeneChip

大脳:4.77

小脳:4.39

脳幹:4.88

脳梁:5.02

松果体:-

末梢神経:5.68

脊柱:5

網膜:-

目:-

動脈:5.40

静脈:5.29

リンパ節:6.11

末梢血:-

脾臓:6.86

胸腺:6.26

骨髄:5.04

脂肪:5.56

骨:-

皮膚:5.16

CAGE

大脳:1.58

小脳:-

脳幹:1.98

脳梁:1.91

松果体:1.58

末梢神経:-

脊柱:2.26

網膜:-

目:-

動脈:2.51

静脈:2.99

リンパ節:2.94

末梢血:-

脾臓:3.38

胸腺:3.03

骨髄:-

脂肪:3.10

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.43

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:3.07

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:1.83

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:27.30

胎盤:18.20

前立腺:22.50

卵巣:-

精巣:17.30

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:42.50

腸:64.80

結腸:25.40

肝臓:-

肺:78.20

膀胱:125.60

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:101.60

膵臓:8.90

乳腺:92.90

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.93

胎盤:5.86

前立腺:6.52

卵巣:6.03

精巣:4.89

心臓:5.65

骨格筋:4.88

食道:5.66

胃:5.57

腸:5.22

結腸:5.29

肝臓:6.05

肺:6.38

膀胱:-

腎臓:5.22

下垂体:5.65

甲状腺:5.73

副腎:5.65

膵臓:5.39

乳腺:5.49

唾液腺:5.91

CAGE

子宮:2.50

胎盤:2.86

前立腺:2.87

卵巣:2.66

精巣:1.71

心臓:2.59

骨格筋:1.20

食道:2.57

胃:-

腸:3.07

結腸:2.84

肝臓:2.61

肺:3.30

膀胱:2.46

腎臓:2.54

下垂体:2.62

甲状腺:2.93

副腎:-

膵臓:2.08

乳腺:2.64

唾液腺:1.15

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.68

卵巣:3.41

精巣:2.68

心臓:1.57

骨格筋:0.89

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.34

肝臓:1.92

肺:3.00

膀胱:-

腎臓:2.99

下垂体:-

甲状腺:2.49

副腎:2.78

膵臓:-

乳腺:2.37

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_022168
Gene ID	64135
Unigene ID	Hs.163173
Probe set ID	219209_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000115267
GTEx ID	ENSG00000115267

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_001164477, NM_027835
ラット[1]	NM_001109199, NM_027835

染色体

2q24.2 [163,123,589 - 163,175,213]

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- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR014001	DEAD-like helicase, N-terminal
IPR014021	Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0009597	detection of virus
GO:0045087	innate immune response
GO:0032480	negative regulation of type I interferon production
GO:0032727	positive regulation of interferon-alpha production
GO:0032728	positive regulation of interferon-beta production
GO:0016925	protein sumoylation
GO:0042981	regulation of apoptosis
GO:0034344	regulation of type III interferon production
GO:0009615	response to virus
GO:0019048	virus-host interaction

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0005524	ATP binding
GO:0003677	DNA binding
GO:0003725	double-stranded RNA binding
GO:0004386	helicase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0043021	ribonucleoprotein binding
GO:0003727	single-stranded RNA binding
GO:0008270	zinc ion binding

interferon induced with helicase C domain 1

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function