splicing factor, arginine/serine-rich 3

同義遺伝子名

SFRS3, SRp20, splicing factor, arginine/serine-rich 3, SRP20, Splicing factor, arginine/serine-rich 3, Pre-mRNA-splicing factor SRP20

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:163.60

小脳:176.30

脳幹:-

脳梁:58.30

松果体:-

末梢神経:214.70

脊柱:224.60

網膜:237.30

目:152.80

動脈:359.70

静脈:133.30

リンパ節:242.60

末梢血:145.70

脾臓:189.10

胸腺:257.70

骨髄:157.40

脂肪:121

骨:102.40

皮膚:220.80

GeneChip

大脳:8.41

小脳:9.04

脳幹:8.50

脳梁:8.65

松果体:-

末梢神経:9.04

脊柱:8.69

網膜:-

目:-

動脈:9.20

静脈:9.41

リンパ節:9.39

末梢血:-

脾臓:9.35

胸腺:10.20

骨髄:9.50

脂肪:9.21

骨:-

皮膚:9.46

CAGE

大脳:4.26

小脳:-

脳幹:4.37

脳梁:4.45

松果体:4.43

末梢神経:-

脊柱:4.64

網膜:-

目:-

動脈:4.62

静脈:4.51

リンパ節:4.50

末梢血:-

脾臓:4.51

胸腺:4.95

骨髄:-

脂肪:4.57

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:5.34

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:4.07

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:5.27

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:173.20

胎盤:134.80

前立腺:202.80

卵巣:409.90

精巣:246.60

心臓:357.60

骨格筋:221

食道:342.80

胃:191.20

腸:421.20

結腸:118.70

肝臓:253.30

肺:312.80

膀胱:-

腎臓:301.50

下垂体:232

甲状腺:655

副腎:304.70

膵臓:471.20

乳腺:306.70

唾液腺:-

GeneChip

子宮:9.65

胎盤:9.01

前立腺:9.68

卵巣:9.59

精巣:9.33

心臓:9.08

骨格筋:8.55

食道:9.25

胃:9.24

腸:9.09

結腸:9.24

肝臓:8.48

肺:9.33

膀胱:-

腎臓:8.94

下垂体:9

甲状腺:9.40

副腎:9.27

膵臓:8.51

乳腺:9.36

唾液腺:8.75

CAGE

子宮:4.33

胎盤:4.42

前立腺:4.61

卵巣:4.89

精巣:4.28

心臓:4.39

骨格筋:4.28

食道:4.44

胃:-

腸:4.47

結腸:4.20

肝臓:4.33

肺:4.38

膀胱:4.83

腎臓:4.41

下垂体:4.64

甲状腺:4.41

副腎:-

膵臓:4.11

乳腺:4.46

唾液腺:3.97

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:5.07

卵巣:6.69

精巣:5.83

心臓:4.35

骨格筋:2.41

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:4.68

肝臓:4.85

肺:2.56

膀胱:-

腎臓:5.64

下垂体:-

甲状腺:6.11

副腎:6.12

膵臓:-

乳腺:5.59

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_003017
Gene ID	6428
Unigene ID	Hs.405144
Probe set ID	208672_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000112081
GTEx ID	ENSG00000112081

オーソログ対応遺伝子

マウス[5]	NM_013663
ラット[2]	NM_001047907

染色体

6p21.31 [36,562,145 - 36,571,209]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR000504

RNA recognition motif, RNP-1

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0010467	gene expression
GO:0031124	mRNA 3'-end processing
GO:0006406	mRNA export from nucleus
GO:0000398	nuclear mRNA splicing, via spliceosome
GO:0008380	RNA splicing
GO:0006369	termination of RNA polymerase II transcription
GO:0006366	transcription from RNA polymerase II promoter

Cellular Component

GO:0005654

nucleoplasm

Molecular Function

GO:0000166	nucleotide binding
GO:0005515	protein binding
GO:0003723	RNA binding

splicing factor, arginine/serine-rich 3

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function