ring finger and WD repeat domain 2

同義遺伝子名

Ubiquitin-protein ligase COP1, RING finger and WD repeat domain protein 2, FLJ10416, COP1, ring finger and WD repeat domain 2, RNF200, RFWD2, hCOP1, Constitutive photomorphogenesis protein 1 homolog

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:29.60

小脳:12.60

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:112.30

網膜:-

目:64.60

動脈:30

静脈:66.60

リンパ節:70.80

末梢血:36.40

脾臓:37.80

胸腺:38.70

骨髄:78.70

脂肪:80.70

骨:-

皮膚:76.80

GeneChip

nodata

CAGE

大脳:3.15

小脳:-

脳幹:3.23

脳梁:3.29

松果体:3.17

末梢神経:-

脊柱:2.86

網膜:-

目:-

動脈:3.37

静脈:3.67

リンパ節:3.72

末梢血:-

脾臓:3.81

胸腺:4.01

骨髄:-

脂肪:3.66

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.75

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.86

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.09

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:100.20

胎盤:94.70

前立腺:22.50

卵巣:74.50

精巣:73.50

心臓:89.40

骨格筋:20.10

食道:-

胃:254.90

腸:-

結腸:110.20

肝臓:137.20

肺:68.40

膀胱:-

腎臓:31.20

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:44.50

乳腺:83.60

唾液腺:-

GeneChip

nodata

CAGE

子宮:3.71

胎盤:3.33

前立腺:3.27

卵巣:3.22

精巣:3.65

心臓:3.03

骨格筋:2.50

食道:3.37

胃:-

腸:3.61

結腸:3.61

肝臓:3.17

肺:3.51

膀胱:3.18

腎臓:3.16

下垂体:3.37

甲状腺:3.37

副腎:-

膵臓:3.29

乳腺:3.40

唾液腺:3.61

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.19

卵巣:2.12

精巣:2.87

心臓:1.03

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:1.93

肝臓:2.26

肺:1.96

膀胱:-

腎臓:2.45

下垂体:-

甲状腺:1.05

副腎:1.61

膵臓:-

乳腺:1.31

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001001740
Gene ID	64326
Unigene ID	Hs.523744
Probe set ID	-
Ensembl ID	ENSG00000143207
GTEx ID	ENSG00000143207

オーソログ対応遺伝子

マウス[1]	NM_011931
ラット[1]	NM_011931

染色体

1q25.2 [175,911,248 - 176,176,629]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

IPR020472	G-protein beta WD-40 repeat, region
IPR001680	WD40 repeat
IPR019782	WD40 repeat 2
IPR019781	WD40 repeat, subgroup
IPR011046	WD40 repeat-like-containing domain
IPR017986	WD40-repeat-containing domain
IPR015943	WD40/YVTN repeat-like-containing domain

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0006977	DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest
GO:0016567	protein ubiquitination

Cellular Component

GO:0005813	centrosome
GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005925	focal adhesion
GO:0016607	nuclear speck
GO:0005730	nucleolus
GO:0005654	nucleoplasm
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0016874	ligase activity
GO:0005515	protein binding
GO:0008270	zinc ion binding

ring finger and WD repeat domain 2

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function