serine hydroxymethyltransferase 1 (soluble)

同義遺伝子名

Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic, MGC15229, Serine methylase, MGC24556, Glycine hydroxymethyltransferase, SHMT, CSHMT, SHMT1, serine hydroxymethyltransferase 1 (soluble)

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

大脳:-

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:-

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:-

骨:-

皮膚:-

GeneChip

大脳:5.19

小脳:5.57

脳幹:5.39

脳梁:5.27

松果体:-

末梢神経:5.64

脊柱:5.06

網膜:-

目:-

動脈:5.55

静脈:4.96

リンパ節:5.49

末梢血:-

脾臓:5.28

胸腺:6.22

骨髄:5.69

脂肪:6.70

骨:-

皮膚:6.36

CAGE

大脳:2.33

小脳:-

脳幹:2.59

脳梁:2.94

松果体:1.41

末梢神経:-

脊柱:2.49

網膜:-

目:-

動脈:2.50

静脈:2.95

リンパ節:2.99

末梢血:-

脾臓:3.36

胸腺:3.43

骨髄:-

脂肪:3.50

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.80

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:1.87

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.78

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

子宮:-

胎盤:-

前立腺:-

卵巣:-

精巣:-

心臓:-

骨格筋:-

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:-

肝臓:-

肺:-

膀胱:-

腎臓:-

下垂体:-

甲状腺:-

副腎:-

膵臓:-

乳腺:-

唾液腺:-

GeneChip

子宮:5.33

胎盤:5.17

前立腺:5.65

卵巣:5.36

精巣:6.44

心臓:5.35

骨格筋:6.01

食道:7.33

胃:5.42

腸:6.07

結腸:6.05

肝臓:8.55

肺:5.03

膀胱:-

腎臓:8.28

下垂体:5.39

甲状腺:6.03

副腎:5.02

膵臓:5.30

乳腺:5.80

唾液腺:6.14

CAGE

子宮:2.65

胎盤:2.26

前立腺:2.55

卵巣:2.68

精巣:3.13

心臓:1.96

骨格筋:2.55

食道:3.45

胃:-

腸:3.91

結腸:3.61

肝臓:5.67

肺:2.60

膀胱:2.33

腎臓:4.98

下垂体:1.51

甲状腺:3.49

副腎:-

膵臓:2.54

乳腺:3.67

唾液腺:3.64

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:1.19

卵巣:0.86

精巣:1.12

心臓:0.35

骨格筋:1.51

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.26

肝臓:4.59

肺:0.82

膀胱:-

腎臓:3.97

下垂体:-

甲状腺:1.48

副腎:1.28

膵臓:-

乳腺:2.73

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_148918
Gene ID	6470
Unigene ID	Hs.636044
Probe set ID	209980_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000176974
GTEx ID	ENSG00000176974

オーソログ対応遺伝子

マウス[4]	NM_009171
ラット[1]	NM_001047842

染色体

17p11.2 [18,231,187 - 18,266,832]

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- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

GO:0045329	carnitine biosynthetic process
GO:0034641	cellular nitrogen compound metabolic process
GO:0046655	folic acid metabolic process
GO:0019264	glycine biosynthetic process from serine
GO:0006565	L-serine catabolic process
GO:0051289	protein homotetramerization
GO:0051262	protein tetramerization
GO:0009113	purine base biosynthetic process
GO:0006766	vitamin metabolic process
GO:0006767	water-soluble vitamin metabolic process

Cellular Component

GO:0005737	cytoplasm
GO:0005829	cytosol
GO:0005739	mitochondrion
GO:0005634	nucleus

Molecular Function

GO:0016597	amino acid binding
GO:0004372	glycine hydroxymethyltransferase activity
GO:0008732	L-allo-threonine aldolase activity
GO:0042803	protein homodimerization activity
GO:0030170	pyridoxal phosphate binding

serine hydroxymethyltransferase 1 (soluble)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function