serine hydroxymethyltransferase 2 (mitochondrial)

同義遺伝子名

serine hydroxymethyltransferase 2 (mitochondrial), SHMT, Glycine hydroxymethyltransferase, SHMT2, Serine methylase, GLYA

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:7.24

小脳:7.53

脳幹:7.31

脳梁:7.16

松果体:-

末梢神経:7.46

脊柱:7.26

網膜:-

目:-

動脈:8.02

静脈:7.87

リンパ節:8.46

末梢血:-

脾臓:8.13

胸腺:8.15

骨髄:8.09

脂肪:7.92

骨:-

皮膚:8.14

CAGE

大脳:3.08

小脳:-

脳幹:3.37

脳梁:3.18

松果体:2.83

末梢神経:-

脊柱:3.29

網膜:-

目:-

動脈:3.67

静脈:4.14

リンパ節:4.34

末梢血:-

脾臓:4.42

胸腺:4.35

骨髄:-

脂肪:3.91

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:0.79

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:0.37

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:0.28

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:7.71

胎盤:7.50

前立腺:7.55

卵巣:7.94

精巣:6.87

心臓:7.70

骨格筋:7.64

食道:8.50

胃:8.29

腸:8.37

結腸:8.14

肝臓:10.13

肺:7.55

膀胱:-

腎臓:8.25

下垂体:7.59

甲状腺:7.50

副腎:7.98

膵臓:8.38

乳腺:8.04

唾液腺:7.88

CAGE

子宮:3.73

胎盤:4.01

前立腺:3.69

卵巣:4.16

精巣:3.26

心臓:3.60

骨格筋:3.71

食道:4.38

胃:-

腸:3.71

結腸:3.79

肝臓:5.72

肺:3.45

膀胱:3.62

腎臓:3.98

下垂体:3.18

甲状腺:3.78

副腎:-

膵臓:4.81

乳腺:3.64

唾液腺:4.32

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:0.17

卵巣:0.15

精巣:0.16

心臓:0.00

骨格筋:0.00

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:0.89

肝臓:1.50

肺:0.09

膀胱:-

腎臓:0.36

下垂体:-

甲状腺:1.37

副腎:1.03

膵臓:-

乳腺:0.00

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_001166358
Gene ID	6472
Unigene ID	-
Probe set ID	214096_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000182199
GTEx ID	ENSG00000182199

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_028230
ラット [0]

染色体

12q13.3 [57,623,110 - 57,628,718]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0019264	glycine biosynthetic process from serine
GO:0006564	L-serine biosynthetic process
GO:0006730	one-carbon metabolic process
GO:0008284	positive regulation of cell proliferation
GO:0051289	protein homotetramerization

GO:0015630	microtubule cytoskeleton
GO:0005743	mitochondrial inner membrane
GO:0005758	mitochondrial intermembrane space
GO:0005759	mitochondrial matrix
GO:0042645	mitochondrial nucleoid
GO:0005739	mitochondrion

GO:0016597	amino acid binding
GO:0003682	chromatin binding
GO:0004372	glycine hydroxymethyltransferase activity
GO:0042802	identical protein binding
GO:0008732	L-allo-threonine aldolase activity
GO:0030170	pyridoxal phosphate binding

serine hydroxymethyltransferase 2 (mitochondrial)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function