serine hydroxymethyltransferase 2 (mitochondrial)

同義遺伝子名

serine hydroxymethyltransferase 2 (mitochondrial), SHMT, Glycine hydroxymethyltransferase, SHMT2, Serine methylase, GLYA

正常組織・臓器 40分類
細胞株・初代培養細胞・成体組織・胎児組織 (FANTOM5 CAGE)

発現マップ on BodyParts3D

相対発現量を、人体 3D 画像にマップしたものです。Genechip 組織40分類の発現パターンを使用しています。

組織40分類別データ

脳

血

結

EST

nodata

GeneChip

大脳:4.85

小脳:5.40

脳幹:4.93

脳梁:4.70

松果体:-

末梢神経:5.03

脊柱:4.82

網膜:-

目:-

動脈:5.47

静脈:5.35

リンパ節:5.95

末梢血:-

脾臓:5.63

胸腺:6.42

骨髄:6

脂肪:5.59

骨:-

皮膚:5.92

CAGE

大脳:3.08

小脳:-

脳幹:3.37

脳梁:3.18

松果体:2.83

末梢神経:-

脊柱:3.29

網膜:-

目:-

動脈:3.67

静脈:4.14

リンパ節:4.34

末梢血:-

脾臓:4.42

胸腺:4.35

骨髄:-

脂肪:3.91

骨:-

皮膚:-

RNA-seq

大脳:1.38

小脳:-

脳幹:-

脳梁:-

松果体:-

末梢神経:-

脊柱:-

網膜:-

目:-

動脈:-

静脈:-

リンパ節:2.60

末梢血:-

脾臓:-

胸腺:-

骨髄:-

脂肪:2.41

骨:-

皮膚:-

殖

筋

消

肝

肺

腎

泌

EST

nodata

GeneChip

子宮:5.67

胎盤:5.62

前立腺:5.59

卵巣:5.71

精巣:4.44

心臓:5.32

骨格筋:5.56

食道:6.11

胃:5.87

腸:6

結腸:6.12

肝臓:7.72

肺:5.19

膀胱:-

腎臓:5.85

下垂体:4.89

甲状腺:5.01

副腎:5.30

膵臓:6.48

乳腺:5.71

唾液腺:5.61

CAGE

子宮:3.73

胎盤:4.01

前立腺:3.69

卵巣:4.16

精巣:3.26

心臓:3.60

骨格筋:3.71

食道:4.38

胃:-

腸:3.71

結腸:3.79

肝臓:5.72

肺:3.45

膀胱:3.62

腎臓:3.98

下垂体:3.18

甲状腺:3.78

副腎:-

膵臓:4.81

乳腺:3.64

唾液腺:4.32

RNA-seq

子宮:-

胎盤:-

前立腺:2.01

卵巣:2.42

精巣:2.12

心臓:1.37

骨格筋:2.16

食道:-

胃:-

腸:-

結腸:2.13

肝臓:2.21

肺:0.61

膀胱:-

腎臓:2.41

下垂体:-

甲状腺:2.45

副腎:2.17

膵臓:-

乳腺:2.19

唾液腺:-

IDs

Refseq ID	NM_005412
Gene ID	6472
Unigene ID	-
Probe set ID	214437_s_at [HG-U133_Plus_2]
Ensembl ID	ENSG00000182199
GTEx ID	ENSG00000182199

オーソログ対応遺伝子

マウス[2]	NM_028230
ラット [0]

染色体

12q13.3 [57,623,110 - 57,628,718]

近くの遺伝子を探す
- -5kb から +5kb の範囲
- -10kb から +10kb の範囲

GO:0019264	glycine biosynthetic process from serine
GO:0006564	L-serine biosynthetic process
GO:0006730	one-carbon metabolic process
GO:0008284	positive regulation of cell proliferation
GO:0051289	protein homotetramerization

GO:0015630	microtubule cytoskeleton
GO:0005743	mitochondrial inner membrane
GO:0005758	mitochondrial intermembrane space
GO:0005759	mitochondrial matrix
GO:0042645	mitochondrial nucleoid
GO:0005739	mitochondrion

GO:0016597	amino acid binding
GO:0003682	chromatin binding
GO:0004372	glycine hydroxymethyltransferase activity
GO:0042802	identical protein binding
GO:0008732	L-allo-threonine aldolase activity
GO:0030170	pyridoxal phosphate binding

serine hydroxymethyltransferase 2 (mitochondrial)

同義遺伝子名

発現データ

発現マップ on BodyParts3D

組織40分類別データ

詳細情報

IDs

オーソログ対応遺伝子

染色体

遺伝子ファミリー (Interpro ID)

Link to Pubmed (Pubmed ID)

遺伝子オントロジー (GO ID)

Biological Process

Cellular Component

Molecular Function